برآورد اندازه موثر جمعیت در گاو سرابی بر اساس نشانگرهای چندشکل تک نوکلیوتیدی

این مطالعه با هدف برآورد اندازۀ موثر تعداد افراد در حال جفتگیری در جمعیت گاو سرابی با روش هتروزیگوسیتی اضافی و بر پایۀ استفاده از نشانگرهای متراکم چندشکل تکنوکلیوتیدی انجام گرفت. بدین منظور از 22 راس گاو سرابی نمونهبرداری شد. تعیین ژنوتیپ نمونهها با چیپ متوسط. گرفت صورت SNP جایگاه 777922 شامل Illumina High-density Bovine BeadChip هتروزیگوسیتی مورد انتظار، متوسط هتروزیگوسیتی مشاهدهشده، متوسط فراوانی آللهای نادر و درصد آللهای در حالت عدم تعادل هاردی-وینبرگ در مجموعۀ دادهها برآورد شد. اندازۀ موثر تعداد افراد در حال جفتگیری بر اساس روش هتروزیگوسیتی اضافی و به کمک نرمافزار (v2 (NEESTIMATOR به ازای هریک از کروموزومها جداگانه برآورد شد. متوسط اندازۀ موثر برآوردشده، 22 فرد بود و متوسط فاصلۀ اطمینان 99 %برای این برآوردها 3/17 تا 2/42 به دستآمد. نتایج مطالعه نشان داد که گاو بومی سرابی در معرض خطر جدی انقراض قرار دارد و تدوین برنامههایی برای حفاظت از گاوهای خالص باقیمانده ضروری است.

کلیدواژه ها:

چندشکلی تکنوکلیوتیدی ، ژنتیک حفاظت ، گاو سرابی ، هتروزیگوسیتی اضافی