تشخیص نوع سرطان پستان با استفاده از انتخاب ژن های موثر از داده های ریزآرایه

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 687

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJBD-12-1_004

تاریخ نمایه سازی: 29 مهر 1398

چکیده مقاله:

مقدمه: تشخیص زودهنگام سرطان پستان و ژ ن های موثر در آن نقش بسیار کلیدی در درمان و حیات بیمار ایفا می کند. با استفاده ازداده های بیان ژن استخراج شده از فناوری ریزآرایه و الگوریتم های یادگیری ماشین می توان رو ش های نوین و هوشمندی درنظام سلامت و درمان ارایه داد که با دقت بالایی قادر به تشخیص سرطان پستان باشند. روش بررسی: داده های استفاده شده در این پژوهش، شامل داده های بیان 9216 ژن مربوط به 84 بیمار در 5 نوع مختلف سرطان است که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است. در این مطالعه برای افزایش کارایی سیستم های تشخیص سرطان پستان، روش انتخاب ویژگی مبتنی بر ارتباط بین بیان غیرنرمال ژن و سرطان ارایه شده است. سپس از سه دسته بند پرکاربرد و رایج K نزدیک ترین همسایه KNN ، ماشین بردار پشتیبان SVM و بیزی ساده NBبرای سنجش کارایی ژن های انتخاب شده استفاده شد. یافته ها: بررسی های انجام شده نشان دادند که با روش انتخاب ویژگی پیشنهادی و با استفاده از دسته بند KNN می توان فقط با انتخاب 38 ژن از میان 9216 ژن مربوط به داده های بیماران سرطانی که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است، انواع سرطان پستان بیماران در داده های آزمایش را با دقت 100 % تشخیص داد و ژن های مرتبط با هر کلاس را نیز تفکیک کرد. همچنین با استفاده از دسته بند NB دقت 90 % با 17 ژن و با دسته بند SVM دقت 96/67، با 22 ژن انتخابی به دست آمد نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان دادند که روش انتخاب ویژگی پیشنهادی، با در نظر گرفتن همزمان دو معیار دقت و تعداد ژن انتخابی، عملکرد مناسبی نسبت به سایر روش ها دارد. توانایی تفکیک ژن های موثر در هر کلاس سرطان، به علاوه تشخیص بیان بیشتر از حد یا کمتر از حد ژن های انتخابی، از خصوصیات ویژه روش پیشنهادی است که می تواند مورد استفاده متخصصین و پژوهشگران حوزه درمان و مراقبت قرار گیرد.

نویسندگان

سیدابوالفضل طباطبایی

گروه مهندسی کامپیوتر، پردیس فنی و مهندسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران

ولی درهمی

گروه مهندسی کامپیوتر، پردیس فنی و مهندسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران

راضیه شیخ پور

گروه مهندسی کامپیوتر، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران

محمدرضا پژوهان

گروه مهندسی کامپیوتر، پردیس فنی و مهندسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران