ساختار فیلوژنتیکی گونه Trichoderma harzianum جداشده از برخی اقلیم های ایران

استرین های قارچ Trichoderma harzianum به دلیل کاربرد در کنترل بیولوژیک بیماری های گیاهی و تأثیر بر زندگی بشر، اهمیت فراوانی دارند. در تحقیق حاضر، ساختار فیلوژنتیکی این گونه به دست آمده از مناطق جغرافیایی مختلف و زیستگاه های متنوع در برخی اقلیم های ایران SCD ،NCوCSW بررسی شد. به منظور بررسی و غربال اولیه، انگشت نگاری 239 جدایه به دست آمده از جنس Trichoderma با استفاده از نشانگر RAPD-PCR انجام گرفت. براساس گروه بندی انجام گرفته، تعدادی جدایه از هر گروه به منظور تعیین توالی ناحیه ITS1-5.8 s- ITS2 از rDNA انتخاب شدند. در مجموع،176 جدایه از گونه T. harzianum به دست آمد از این میان،76 جدایه که برای ناحیه ITS آنها تعیین توالی انجام گرفته بود، با روش ماکسیمم پارسیمونی تجزیه وتحلیل فیلوژنتیکی شدند. در نتیجه، این جدایه ها در 10 فیلوتیپ phylotype جای گرفتند. فیلوتیپ A با یک جدایه4414 نماینده آالل جدیدی از ITS در گونه T. harzianum می باشد، که بومی ایران است. یافتن این آلل منحصر به فرد در اقلیم CSW در شمال ایران، می تواند بیانگر تأثیر این شرایط اقلیمی در ظهور این آلل جدید در گونه T. harzianumباشد.

کلیدواژه ها:

آلل ، فیلوژنی ، فیلوتیپ ، کنترل بیولوژیک ، .ITS