CIVILICA We Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

Computer Aided Design of a Luciferase Like Haloalkane Dehalogenase Enzyme by Homology Based Rational Protein Design (HRPD) Method

اعتبار موردنیاز : ۱ | تعداد صفحات: ۹ | تعداد نمایش خلاصه: ۱۸۷ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۴
کد COI مقاله: JR_JABR-2-4_001
زبان مقاله: انگلیسی
حجم فایل: ۹۸۶.۱۶ کیلوبایت (فایل این مقاله در ۹ صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد)

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

اگر در مجموعه سیویلیکا عضو نیستید، به راحتی می توانید از طریق فرم روبرو اصل این مقاله را خریداری نمایید.
با عضویت در سیویلیکا می توانید اصل مقالات را با حداقل ۳۳ درصد تخفیف (دو سوم قیمت خرید تک مقاله) دریافت نمایید. برای عضویت در سیویلیکا به صفحه ثبت نام مراجعه نمایید. در صورتی که دارای نام کاربری در مجموعه سیویلیکا هستید، ابتدا از قسمت بالای صفحه با نام کاربری خود وارد شده و سپس به این صفحه مراجعه نمایید.
لطفا قبل از اقدام به خرید اینترنتی این مقاله، ابتدا تعداد صفحات مقاله را در بالای این صفحه کنترل نمایید.
برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای ۹ صفحه است در اختیار داشته باشید.

قیمت این مقاله : ۳,۰۰۰ تومان

آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله Computer Aided Design of a Luciferase Like Haloalkane Dehalogenase Enzyme by Homology Based Rational Protein Design (HRPD) Method

Raghunath Satpathy - School of Life science, Sambalpur University, Jyoti vihar, Burla, Odisha, India
v Badireenath Konkimalla - School of Biological Sciences, National Institute of Science Education and Research (NISER), Bhubaneswar, Odisha, India
Jagnyeswar Ratha - School of Life science, Sambalpur University,Jyoti vihar, Burla, Odisha, India

چکیده مقاله:

Rational protein design is an important aspect to introduce novel characters to the enzymes. In this report, we describe a procedure for in-silico design of a novelhaloalkane dehalogenase protein that exhibits luciferase property, which can be potentially used in biosensor applications. The haloalkane dehalogenase have aclose structural homology with a lucifearse was used as the starting structure for design. Amino acids that are frequently interacts with the chromophre (colentrizine)was analyzed by docking and molecular dynamics simulation. The amino acids Asp170, Lys192, Arg193, Lys259, and Lys261 were selected in the enzyme structurefor substitution purpose to generate mutant enzyme. Following several selection strategies, it was observed that the protein substituted with Phe in all the positions is the best one which was further validated by a 10 ns molecular dynamicssimulation. The designed protein is then analyzed for its substrate specificity towards 10 selected toxic haloalkane compounds. The result shows, that thedesigned protein has also improved the substrate specificity towards four toxic pollutants.

کلیدواژه‌ها:

Protein Design, Chromophore, Luciferase, Haloalkane Dehalogenase, Docking, Molecular Dynamics Simulation

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-JR_JABR-JR_JABR-2-4_001.html
کد COI مقاله: JR_JABR-2-4_001

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Satpathy, Raghunath; v Badireenath Konkimalla & Jagnyeswar Ratha, ۱۳۹۴, Computer Aided Design of a Luciferase Like Haloalkane Dehalogenase Enzyme by Homology Based Rational Protein Design (HRPD) Method, Journal of Applied Biotechnology Reports 2 (4), https://www.civilica.com/Paper-JR_JABR-JR_JABR-2-4_001.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (Satpathy, Raghunath; v Badireenath Konkimalla & Jagnyeswar Ratha, ۱۳۹۴)
برای بار دوم به بعد: (Satpathy; Badireenath Konkimalla & Ratha, ۱۳۹۴)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.