ارزیابی روابط ژنتیکی ارقام امیدبخش و تجاری زیتون با استفاده از چند شکلی نشانگرهای هدفمند مبتنی بر جعبه CAAT ژن ها (CBDP)

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 424

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-10-4_006

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

هدف: زیتون به عنوان یکی از مهم­ترین گیاهان باغی دارای تعداد ارقام فراوانی در جهان است. لذا، هدف این پژوهش، مطالعه تنوع ژنتیکی مجموعه­ای از ارقام زیتون ایستگاه طارم ایران بود. مواد و روش­ها: در این تحقیق از 25 نشانگر CBDP برای بررسی روابط و تنوع ژنتیکی 20 رقم زیتون تجاری و امیدبخش ایرانی و خارجی استفاده شد. نتایج: 25 آغازگر مورد استفاده در مجموع 755 قطعه (آلل) چند شکل تکثیر دادند و میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) و شاخص نشانگری (MI) آغازگرها به ترتیب 941/0 و 64/5 بود که بیانگر کارایی و قدرت تمایز بالای نشانگرهای CBDP می­باشد. پارامترهای ژنتیکی تنوع ژنی نی (H) و شاخص شانون (I) در ارقام خارجی نسبت به ارقام ایرانی بالاتر بودند. جریان ژنی (NM) بالایی (46/4) بین ارقام زیتون مشاهده شد که این نتیجه مقادیر پایین شاخص­های تمایز بین جمعیتی (Gst) و FsT را تایید کرد. تجزیه واریانس ملکولی (AMOVA) به ترتیب 17 و 83 درصد از تغییرات کل ژنتیکی را به تنوع بین گروهی (ارقام ایرانی و خارجی) و درون گروهی تفکیک کرد. تجزیه خوشه­ای با استفاده از ضریب تشابه دایس و روش UPGMA ارقام ایرانی و خارجی را در پنج گروه قرار داد که رقم امیدبخش T24 و رقم خارجی Koroneiki با حداکثر تفاوت با بقیه هر کدام در یک گروه جداگانه قرار گرفتند. تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) توانست به خوبی ارقام امیدبخش ایرانی را از ارقام تجاری ایرانی و خارجی تفکیک کند. تجزیه ساختار (Structure) ژنتیکی جمعیت نیز نتایج حاصل از تجزیه کلاستر و PCoA را تایید کرد و دو گروه ارقام ایرانی و خارجی به وضوح از هم تفکیک شدند. نتیجه گیری: در جمع بندی کلی مشاهده شد که رقم امیدبخش T24 با دارا بودن شباهت ژنتیکی مشترک به هر دو گروه ارقام ایرانی و خارجی می­تواند رقم کاندید مناسبی جهت تجاری­سازی با دارا بودن خصوصیات مکمل هر دو گروه باشد. همچنین استفاده از نشانگرهای CBDP برای بررسی تنوع ژنتیکی سایر ارقام زیتون نیز توصیه می­شود.

نویسندگان

صدیقه فابریکی اورنگ

قزوین دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)

مجید گلمحمدی

عضو هیات علمی، بخش تحقیقات زراعی وباغی، مرکز تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی ومنابع طبیعی، قزوین، ایران.

حمید کریمی

دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و به نژادی گیاهی، دانشگاه بین المللی امام خمینی(ره)، قزوین، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Baldoni L, Tosti N, Ricciolini C et al. (2006) Genetic ...
  • Belaj A, Satovic Z, Rallo L, Trujillo I (2002) Genetic ...
  • Benoist C, Ohare K, Breathnach R, Chambon P (1980) The ...
  • Biton I, Shevtsov S, Ostersetzer O et al. (2012) Genetic ...
  • Bohn M, Utz HF, Melchinger AE (1999) Genetic similarities among ...
  • Chiappetta A, Muto A, Muzzalupo R, Muzzalupo I (2017) New ...
  • Chumacero de Schawe C, Durka W, Tscharntke T et al. ...
  • Donfagsiteli TN, Waswa BW, Muchugi A et al. (2016) Genetic ...
  • Doyle JJ, Doyle JK (1987) A rapid DNA isolation procedure ...
  • Etminan A, Pour-Aboughadareh A, Noori A et al. (2018) Genetic ...
  • Gismondi A, Canini A (2013) Microsatellite analysis of latial (Olea ...
  • Gomes S, Martins-Lopes P, Lopes J, Guedes-Pinto H (2009) Assessing ...
  • Haouane H, El-Bakkali A, Moukhli A et al. (2011) Genetic ...
  • Heidari P, Etminan A, Azizinezhad R, Khosroshahli M (2017) Genomic variation studies in durum wheat (Triticum turgidum ...
  • Heikrujam M, Kumar J, Agrawal V (2015) Genetic diversity analysis ...
  • Landjeva S, Korzon V, Ganeva G (2006) Evaluation of genetic ...
  • Linos A, Nikoloudakis N, Katsiotis A, Hagidimitrious M (2014) Genetic ...
  • Marra FP, Caruso T, Costa F et al.  (2013) Genetic ...
  • Omrani-Sabbaghi A, Shahriari M, Falahati-Anbaran M et al. (2007) Microsatellite ...
  • Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA et al. (2017) Assessment ...
  • Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA et al. (2018) Insight ...
  • Powell W, Morgante M, Andre C et al. (1996) The ...
  • Rajesh MK, Sabana AA, Rachana KE (2015) Genetic relationship and ...
  • Randi E, Lucchini V (2002) Detecting rare introgression of domestic ...
  • Rolf FJ (2000) NTSYS-pc: numerical taxonomy and multivariate analysis system. ...
  • Rouppevander JN, Van-Eck AM, Draaistravan J et al. (1998) An ...
  • Sakar E, Unver H, Ercisli S (2016) Genetic diversity among ...
  • Sarri V, Baldoni L, Porceddu A et al. (2006) Microsatellite ...
  • Sesli M, Yegenoglu ED (2017) Genetic relationships in wild olives ...
  • Shahmuradov IA, Gammerman AJ, Hancock JM et al. (2003) Plant ...
  • Singh AK, Rana MK, Singh S et al. (2014) CAAT ...
  • Tams SH, Melchinger AE, Bauer E (2005) Genetic similarity among ...
  • Terral JF, Alonso N, Capdevila RB et al. (2004) Historical ...
  • Yousefiazar-Khanian M, Asghari A, Ahmadi J et al. (2016) Genetic ...
  • نمایش کامل مراجع