جداسازی، همسانه سازی و توصیف ملکولی ژن های رمزکننده آنزیم های اندونوکلئاز اختصاصی تک رشته از گیاه جعفری (Petroselinum crispum L.)

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 313

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-7-1_012

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

نوکلئازهای اختصاصی تک رشته (خانواده S1/P1)، بطور گسترده در تحقیقات ژنتیک مولکولی مورد استفاده قرار می گیرند. پرکاربردترین آنزیم های این خانواده، اندونوکلئازهای گیاهی هستند که از قابلیت برش اختصاصی نواحی جفت شدگی ناجور در مولکول های DNA هترودوپلکس برخوردارند. تکنیک هضم آنزیمی DNA هترودوپلکس مبتنی بر فعالیت این اندونوکلئازها، یکی از متداول ترین تکنیک های مورد استفاده برای شناسایی جهش های نقطه ای در ژنوم است. در این تحقیق، توالی های ژنی رمزکننده آنزیم های اندونوکلئاز اختصاصی تک رشته از گیاه جعفری (Petroselinum crispum) با استفاده از آغازگرهای هترولوگ در واکنش PCR جداسازی گردیدند. توالی های ژنی جداسازی شده، پس از همسانه سازی و تعیین ماهیت، به نام های PARS I و PARS II نامگذاری شدند. مطالعه نرم افزاری خصوصیات فیزیکوشیمیایی، ساختار مولکولی و قرابت ژنتیکی نشان داد که دو آنزیم PARS I و PARS II به خانواده نوکلئازهای S1/P1 تعلق داشته و شباهت زیادی به نوکلئازهای اختصاصی DNA هترودوپلکس نشان می دهند. با این حال، تعیین مکانیزم فعالیت و ترجیح سوبسترایی این نوکلئازها، مستلزم بررسی فعالیت نمونه خالص طبیعی یا نوترکیب آنها بر روی سوبسترای DNA هترودوپلکس می باشد.

کلیدواژه ها:

نوکلئازهای اختصاصی تک رشته ، جعفری ، هضم آنزیمی DNA هترودوپلکس ، همسانه سازی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aoyagi S, Sugiyama M, Fukuda H (1998). BFN1 and ZEN1 ...
  • Desai NA, Shankar V (2003). Single-strand specific nucleases. FEMS Microbiology ...
  • Doetsch PW, McCray Jr WH, Lee K, Bettler DR, Valenzuela ...
  • Drew HR (1984). Structural specificities of five commonly used DNA ...
  • Henikoff S, Comai L (2003). Single-nucleotide mutations for plant functional ...
  • Iwamatsu A, Aoyama H, Dibo G, Tsunasawa S, Sakiyama F ...
  • Larsen K (2005). Molecular cloning and characterization of a cDNA ...
  • Laskowski SM (1980). Purification and properties of the mung bean ...
  • Maekawa K, Tsunasawa S, Dibo G, Sakiyama F (1991). Primary ...
  • Marshall RD (1979). Glycoproteins. Annual Review of Biochemistry 41: 673–702. ...
  • Matousek J, Podzimek T, Pouckova P, Stehlik J, Skvor J, ...
  • Nielsen H, Engelbrecht J, Brunak S, von Heijne G (1997). ...
  • Nomura A, Suno M, Mizuno Y (1971). Studies on 3´-nucleotidase ...
  • Oleykowski CA, Mullins CRB, Godwin AK, Yeung AT (1998). Mutation ...
  • Panavas T, Pikula A, Reid PD, Rubinstein B, Walker EL ...
  • Perez-Amador MA, Abler ML, DeRocher EJ, Thompson DM, Van Hoof ...
  • Podzimek T, Matousek J, Lipovova P, Pouckova P, Spiwok V, ...
  • Shandilya H, Gerard GF, Qiu P (2009). Nucleic acid sequences ...
  • Sung SC, Laskowski Sr M (1962). A nuclease from mung ...
  • Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, ...
  • Taylor GR, Deeble J (1999). Enzymatic methods for mutation scanning. ...
  • Till BJ, Bortner C, Comai L, Henikoff S (2004). Mismatch ...
  • Triques K, Sturbois B, Gallais S, Dalmais M, Chauvin S, ...
  • Von Heijne G (1985). Signal sequences. Journal of Molecular Biology ...
  • Zolala J, Bahrami AR, Farsi M, Matin M, Yassaee V ...
  • نمایش کامل مراجع