ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

بررسی EST های گندم در برهمکنش با قارچ بیمارگر Mycosphaerella graminicola

محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 7، شماره: 2
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 460

فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/864945

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-7-2_006

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

در این مطالعه، 10438 EST که در پایگاه NCBI در رابطه با تعامل گندم و بیمارگر  Mycosphaerella graminicola  (فرم غیرجنسی Zymoseptoria tritici)  ثبت شده بودند، استخراج شدند. پروتئین­های غیر تکراری و مرتبط با EST­ ها در بانک اطلاعاتی  NCBI  توسط نرم افزار SEQtoolsبه دست آمدند. این پروتئین ها بر اساس نوع، طبقه بندی شده و در 279 گروه قرار گرفتند. سپس در سایتKEGG ، مسیر 112 عدد از این پروتئین­ها تجزیه و تحلیل و 55 مسیر شناسایی و ارتباط بین این مسیرها و پاسخ­های دفاعی گندم مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه این مسیرها بر اساس عملکرد گروه­بندی شده و در هشت گروه عملکردی (شامل پروتئین­های دفاعی، پروتئین­های درگیر در فرایند انرژی سلولی، پروتئین­های درگیر در فرایند متابولیسم سلولی، پروتئین­های درگیر در فرایند پردازش پروتئین­ها، پروتئین­های درگیر در فرایند پردازش RNA، پروتئین­های درگیر در چرخه­های سلولی، پروتئین­های درگیر در تخریب پروتئین­ها و پروتئین­های درگیر در فرایند سیگنال­دهی سلولی) قرار گرفتند. مسیرهای متابولیکی تثبیت کربن در فرایند فتوسنتز و پروتئین­های درگیر در فرایند دفاعی به ترتیب  با دارا بودن 745 و 251 EST، در مرتبه اول و دوم قرار داشتند.. سپس نقش ESTها مخصوصا آن­هایی که در مسیرهای دفاعی گیاهی درگیر بودند به صورت موردی مطالعه شدند و عملکرد آن­ها در مسیر دفاع گیاه گندم مشخص شد. با استفاده از اطلاعاتی که این بررسی در اختیار قرار می دهد می­توان ژن­های دیگری که به طور مستقیم و همچنین غیر مستقیم در فعالیت­های دفاعی گیاهی شرکت می­­کنند، مورد بررسی قرار داد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alscher RG and Cumming JR (1990). Stress Responses in Plants: ...
  • Allen RD (2008). Dissection of oxidative stress tolerance using transgenic ...
  • Berger S, Sinha AK and Roitsch T (2007). Plant physiology ...
  • Bonfig KB, Schreiber U,  Gabler A, Roitsch T, Berger S ...
  • Brading PA, Verstappen ECP, Kema, GHJ, Brown JKM (2002). A ...
  • Chandra A, Saxena R, Dubey A, Saxena P (2007).  Change ...
  • Darestani Farahani M, Safaie N, Alizadeh A 2009. Genetic diversity ...
  • Dracatos PM, Dumsday JL,  Olle RS, Cogan NOI, Dobrowolski MP, ...
  • Feller U, Anders I, Mae T (2008). Rubiscolytics: fate of ...
  • Dixon RA, Reddy MS (2003). Biosynthesis of monolignols. Genomic and ...
  • Gilchrist L, Gomez B, Gonzalez R, Fuentes S, Mujeeb- Kazi ...
  • Goodwin SB, McDonald, BA, and Kema, GHJ (2003). The Mycosphaerellasequencing ...
  • Goswami RS, Xu JR, Trail F, Hilburn K, Kistler HC ...
  • Guo L, Yanhua Y, Xinli X, Weilun Y (2010). Identification ...
  • Ishihara A, Nakao T, Mashimo Y, Murai M, Ichimaru N, ...
  • Kim YM, Bouras N, Kav NN, Strelkov SE (2010). Inhibition ...
  • Majidian P, Zeinalabedini M, Dejampour J, Najafi H, Mardi M, ...
  • Nagaraj SH, Gasser RB, Ranganathan S (2007).A hitchhiker s guide ...
  • Ogata H, Goto S, Sato K, Fujibuchi W, Bono H, ...
  • Parkinson  J, and Blaxter M (2009). Expressed sequence tags: an ...
  • Quaedvlieg W, Kema GHJ, Groenewald JZ., Verkley G J M, ...
  • Pshenichnov E, Khashimova N, Akhunov A, Golubenko Z, Stipanovic RD ...
  • Robert C,  Bancal M C, Lannou C,  Ney B (2006). ...
  • Sasaki K, Iwai T, Hiraga S, Kuroda K, Seo S, ...
  • Yao HJ, and Tian SP (2005). Effect of biocontrol agent ...
    • نمایش کامل مراجع