بررسی تنوع ژنتیکی یک کلکسیون بین المللی برنج به وسیله نشانگر ریزماهواره

مجتبی جهانی مجتبی جهانی; قربانعلی نعمت زاده; قاسم محمدی نژاد

بررسی تنوع ژنتیکی یک کلکسیون بین المللی برنج به وسیله نشانگر ریزماهواره

محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 8، شماره: 1

سال انتشار: 1395

نوع سند: مقاله ژورنالی

زبان: فارسی

مشاهده: 494

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

دریافت فایل کامل مقاله

صدور گواهی نمایه سازی
من نویسنده این مقاله هستم

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > برنج

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

https://civilica.com/doc/864894

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-8-1_002

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

در این تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی برنج مجموعه ای از 95 ژنوتیپ از کشورهای مختلف جمعآوری و با 67 نشانگر ریزماهواره که تمامی کروموزومهای برنج را پوشش میدادند ارزیابی شدند. مجموعا تعداد 303 آلل چندشکل با میانگین 52/4 آلل به ازای هر جایگاه ریزماهواره تکثیر یافت. آماره محتوی اطلاعات چند شکلی دارای میانگین 51/0 در کل جمعیت بود. حداکثر و حداقل محتوی اطلاعات چند شکل به ترتیب مربوط به نشانگر ریزماهواره 10364 RM (81/0) و RM 4862 (11/0) بود. تجزیه خوشهای بر مبنای ضریب فاصله نی ژنوتیپها را بر مبنای تفاوتهای ژنتیکی و مبدا جغرافیایی در 4 گروه اصلی جای داد. تجزیه به مختصات اصلی با در نظر داشتن دو مولفه اول که 15/71 % از تغییرات کل را توجیه میکردند نیز نتایج تجزیه خوشهای را تایید کرد. صحت گروهبندی افراد به وسیله تجزیه واریانس مولکولی ارزیابی و تایید شد. این تحقیق با ارزیابی فواصل ژنتیکی بخشی از ژرم پلاسم برنج ایرانی در مقابل ارقام و لاینهای خارجی نتایج مناسبی برای بهرهوری از ذخایر توارثی داخلی در برنامههای بهنژادی را فراهم میکند.

کلیدواژه ها:

برنج ، تنوع ژنتیکی ، SSR ، تجزیه خوشه ای ، تجزیه به مختصات اصلی

نویسندگان

مجتبی جهانی مجتبی جهانی

دانشجوی دکتری اصلاح نباتات، دانشگاه شهید باهنر کرمان

قربانعلی نعمت زاده

استاد اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

قاسم محمدی نژاد

دانشیار اصلاح نباتات، دانشگاه شهید باهنر کرمان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

Addinsoft, S. A. R. L. (2012). XLstat 2012: Leading Data ...
Agrama HA, Eizenga GC, Yan W (2007). Association mapping of ...
Amini Nasab R, Ebrahimi M.A, Ebadi A.A, Ghodsi M (2012). ...
Abutalebi Sh, Fotokian M.H, Zeinalabedini M (2014). Evaluation of Genetic ...
Ashfaq M, Khan AS (2012). Genetic diversity in basmati rice ...
Borba, T. C. D. O., Brondani, R. P. V., Breseghello, ...
Cao Q, Lu B-R, Xia H, Rong J, Sala F, ...
Choudhary, G., Ranjitkumar, N., Surapaneni, M., Deborah, D. A., Vipparla, ...
Dellaporta S, Wood J, Hicks J (1983). A plant DNA ...
Doebley J, Wendel J, Smith JSC, Stuber C, Goodman M ...
Huang M, Xie F-m, Chen L-y, Zhao X-q, Jojee L, ...
Jackson M, Juggan R (1993). Sharing the diversity of rice ...
Ji YT, Qu CQ, Cao BY (2007). An optimal method ...
Jin L, Lu Y, Xiao P, Sun M, Corke H, ...
Khush, G.S. (2005). What it will take to feed 5.0 ...
Liu K, Muse SV (2005). PowerMarker: an integrated analysis environment ...
Mohammadi S, Prasanna B (2003). Analysis of genetic diversity in ...
Peakall R, Smouse PE (2012). GenAlEx 6.5: genetic analysis in ...
Rotolski IA, VogeI JM, Morgoante M, PoweII IW, Andre C, ...
Smith JS, Chin EC, Shu H, Smith OS, Wall SJ, ...
Smith O, Smith J (1992). Measurement of genetic diversity among ...
Tanksley SD (1983) Molecular markers in plant breeding. Plant Molecular ...
Yan WG, Li Y, Agrama HA, Luo D, Gao F, ...
Zarea R, Mohammadi-Nejad G, Shahsavand-Hassani H (2013). Allelic variation of ...
Zhang, P., Li, J., Li, X., Liu, X., Zhao, X., ...

نمایش کامل مراجع