آنالیزفیلوژنتیکی جمعیت بزهای خلخالی با استفاده ژن سیتوکروم b

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 322

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-9-3_005

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

بز خلخالی یکی از بزهای بومی ایران است که درحال حاضرجمعیت آن به شدت کاهش یافته است. برای حفظ و بهبود تولیدات این گونه مطالعات کاربردی ژنتیکی ضروری است. تحقیق حاضر باهدف توالی­یابی ژن میتوکندریایی سیتوکروم b در 100 راس بز خلخالی و آنالیز بیوانفورماتیک این ژن در گونه­های مختلف بز (با استفاده از 26 نمونه توالی NCBI) انجام شده است. جهت انجام آنالیز از روش توالی یابی ژن و مقایسه آن با اطلاعات موجود در پایگاه اطلاعاتی NCBI استفاده گردید. نتایج آنالیز تنوع ژنتیکی درجمعیت بز خلخالی منجر به شناسایی 5 جهش با 6 هاپلوتایپ مختلف گردید میزان تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلئوتیدی و میانگین تفاوت های نوکلئوتیدی به ترتیب 644/0، 002/0 و 822/1 برآورد شد. مقدار تاجیما D در جمعیت بزهای خلخالی مثبت 124/0 بدست آمد که ازلحاظ آماری معنی دارنبود.نتایج تجزیه تحلیل های بین گونه­های مختلف بزنشان داد که تنوع نوکلئوتیدی در گونه های بز ایبکس، ایگاگروس و هیرکوس به ترتیب 047/0، 022/0 و 001/0 می­باشد. بیشترین فاصله ژنتیکی بین بزهای ایبکس و ایگاگروس و کمترین فاصله ژنتیکی بین گونه خلخالی و بز هیرکوس مشاهده شد. بزهای ایگاگروس در مقایسه با بزهای ایبکس ازلحاظ فاصله ژنتیکی به بزهای اهلی هیرکوس نزدیکتر بودند.

نویسندگان

ویدا دولتی

دانشجوی کارشناسی ارشد علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران.

نعمت هدایت ایوریق

استادیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی.

سعید نیک بین

استادیار علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران.

رضا بهمرام

استادیار علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alinaghizadeh H, Mohammad Abadi MR, Zakizadeh S (2010). Exon 2 ...
  • Amer SAM (2014). Mitochodrial DNA variability among some Saudi Arabian ...
  • Babar ME, Hussain T, Sadia H, Nadeem S, Kamran MZ, ...
  • Baghizadeh A, Bahaaddini M, Mohamadabadi MR. Askari N (2009). Allelic ...
  • Bandelt HJ, Forster P, Röhl A (1999). Median-joining networks for ...
  • Chen S, Fan B, Liu B, Yu M, Zhao S, ...
  • Dolati Garehdarvishlu V, Hedayat Evrigh N, Nikbin S, Behmaram R, ...
  • FAO Statistical Databases (2004). FAOSTAT Agriculture (Available at:http://www.fao.org ) ...
  • Gholizadeh M, Mianji GR, Zadeh HS (2008). Potential use of ...
  • Hedayat-Evrigh N, Vahedi V, Seyed Sharifi R, Boustan A (2016). ...
  • Jiyanto J, Sutopo S, Kurnianto E (2014). The genetic diversity ...
  • Karimi V, Hedayet Evrigh N, Seyed Sharifi R, Nikbin S ...
  • Karimi V, Hedayet Evrigh N, Seyed Sharifi R, Nikbin S, ...
  • Kim JH, Byun MJ, Kim MJ, Suh SW, Kim YS, ...
  • Liu YP, Cao SX, Chen SY, Yao YG, Liu TZ ...
  • Moghadaszadeh M, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh Koshkoieh A (2015). Association of ...
  • Parson W, Pegoraro K, Niederstatter H, Fofer M, Teil echner ...
  • Pidancier N, Jordan S, Gordon Luikart G, Pierre Taberlet P ...
  • Rahman ANMA, Ramli A, Wan Embong W (2008). A review ...
  • Rout P, Thangraj K, Mamdal A, Roy R (2012). Genetic ...
  • Sawaimul AD, Sahare MG, Ali SZ, Sirothia AR, Kumar S ...
  • Sepehri B, Seyedabadi HR (2015). Molecular analysis of khalkhali goat ...
  • Shabthar SMN, Rosli MKN, Mohd-Zin NAA, Romaino SMN, Fazly-Ann ZN, ...
  • Association of growth trait and Leptin gene polymorphism in Kermani sheep [مقاله ژورنالی]
  • Song X, Xu C, Yue Z, Wang L, Wang G, ...
  • Tajima F (1989). Statistical method for testing the neutral mutation ...
  • Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, ...
  • Tobe SS, Linacre AM (2008). A multiplex assay to identify ...
  • Wisnieska MN, Slota E, Kalisz B (2010). Use of cytochrome ...
  • Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR, Saki AA, Ershadi A, ...
  • نمایش کامل مراجع