CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)
عنوان
مقاله

ارزیابی ساختار ژنتیکی شتر با استفاده از روش های PCA و خوشه بندی سلسله مراتبی

اعتبار موردنیاز PDF: ۱ | تعداد صفحات: ۱۴ | تعداد نمایش خلاصه: ۱۱ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۵
کد COI مقاله: JR_JOAGK-8-3_006
زبان مقاله: فارسی
حجم فایل: ۳۸۸.۰۹ کیلوبایت (فایل این مقاله در ۱۴ صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد)

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

متن کامل این مقاله دارای ۱۴ صفحه در فرمت PDF قابل خریداری است. شما می توانید از طریق بخش روبرو فایل PDF این مقاله را با پرداخت اینترنتی ۳,۰۰۰ تومان بلافاصله دریافت فرمایید
قبل از اقدام به دریافت یا خرید مقاله، حتما به فرمت مقاله و تعداد صفحات مقاله دقت کامل را مبذول فرمایید.
علاوه بر خرید تک مقاله، می توانید با عضویت در سیویلیکا مقالات را به صورت اعتباری دریافت و ۲۰ تا ۳۰ درصد کمتر برای دریافت مقالات بپردازید. اعضای سیویلیکا می توانند صفحات تخصصی شخصی روی این مجموعه ایجاد نمایند.
برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

خرید و دانلود فایل PDF مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای ۱۴ صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله ارزیابی ساختار ژنتیکی شتر با استفاده از روش های PCA و خوشه بندی سلسله مراتبی

  مهرداد قاسمی میمندی - دانش اموخته کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنرکرمان
    محمدرضا محمدآبادی - استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر، کرمان، ایران
  مهدیه منتظری - دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران/ انجمن پژوهشگران جوان، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران.

چکیده مقاله:

الگوهای حاصل از داده­های مولکولی می­توانند جهت شناسایی ارتباط میان جمعیت­های یک گونه به کار گرفته شوند. در ایران، شتر به عنوان یکی از منابع مهم جهت تامین شیر، گوشت و الیاف کاربرد گسترده­ای دارد. با استفاده از 8 جفت نشانگر ریزماهواره (YWLL08، VOLP03، VOLP08، YWLL38، CVR01، YWLL44،  VOLP32 وVOLP67 ) ساختار و فاصله ژنتیکی جمعیت 81 نفره شتر، ارزیابی گردید. با استفاده از روش نمکی بهینه یافته، DNA ژنومی شترها استخراج و تکثیر جایگاه­های ریزماهواره از طریق واکنش زنجیره­ای پلیمراز با موفقیت انجام شد و فرآورده­های حاصل روی ژل پلی­آکریل­آمید 8% واسرشته­ساز الکتروفورز شدند. بیشترین فاصله ژنتیکی بین جمعیت شهربابک و صحرای جهاد (56/0) و کمترین آن بین دو جمعیت رفسنجان (11/0) مشاهده گردید. نتایج PCA به بهترین شکل تعداد گروه­های ژنتیکی موجود در مجموعه داده­ها را توجیه کرد و نشان داد که کل نمونه­ها به 3 مولفه اصلی تفکیک شدند. هم­چنین نتایج خوشه­بندی سلسله مراتبی نشان داد که در اولین سطح خوشه­بندی، جمعیت­های شهربابک، رفسنجان 1 و رفسنجان 2 در خوشه مشترکی قرار دارند و جمعیت شمشیرآباد خوشه متمایز دیگری را به خود اختصاص داده است، در حالی­که جمعیت صحرای جهاد در یک خوشه کاملا مستقل قرار گرفته است. در کل نتایج حاصل از این مطالعه نشان دهنده مطابقت خوشه­بندی ژنتیکی جمعیت­ها با فواصل جغرافیایی آنهاست.

کلیدواژه‌ها:

شتر, تجزیه و تحلیل مولفه های اصلی, خوشه بندی سلسله مراتبی, فاصله ژنتیکی

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-JR_JOAGK-JR_JOAGK-8-3_006.html
کد COI مقاله: JR_JOAGK-8-3_006

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
قاسمی میمندی, مهرداد؛ محمدرضا محمدآبادی و مهدیه منتظری، ۱۳۹۵، ارزیابی ساختار ژنتیکی شتر با استفاده از روش های PCA و خوشه بندی سلسله مراتبی، دوفصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی 8 (3)، https://www.civilica.com/Paper-JR_JOAGK-JR_JOAGK-8-3_006.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (قاسمی میمندی, مهرداد؛ محمدرضا محمدآبادی و مهدیه منتظری، ۱۳۹۵)
برای بار دوم به بعد: (قاسمی میمندی؛ محمدآبادی و منتظری، ۱۳۹۵)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • Abdallah HR, Faye B (2012). Phenotypic classification of Saudi Arabian ...
  • Abdussamad AM, Charruau P, Kalla DJU, Burger PA (2015). Validating ...
  • Ansari-Renani HR, Salehi M, Ebadi Z, Moradi S (2010). Identification ...
  • Barazandeh A (2016). Whole genome CpG islands investigation in Camelid ...
  • Barazandeh A, Mohammadabadi MR, Ghaderi M, Nezamabadipour H (2016a). Genome-wide ...
  • Barazandeh A, Mohammadabadi MR, Ghaderi M, Nezamabadipour H (2016b). Predicting ...
  • Banerjee P, Joshi J, Upasan S, Ganai N, Vijh RK ...
  • Barker JSF (1994). A global protocol for determining genetic distances ...
  • Chauhan T, Lal KK, Mohindra V, Singh R, Punia O, ...
  • Edea Z, Dadi H, Kim SW, Dessie T, Lee T, ...
  • Eltanany M, Elfaroug SO, Distl O (2015). Assessment of genetic ...
  • Gershon D (2002). Microarray technology: an array of opportunities. Nature ...
  • Groeneveld LF, Lenstra JA, Eding H, Toro MA, Scherf B ...
  • Herrero-Medrano JM, Megens H, Groenen MAM, Ramis G, Bosse M, ...
  • Javanmard A, Mohammadabadi MR, Zarrigabayi GE, Gharahedaghi AA, Nassiry MR, ...
  • Ji R, Cui P, Ding F, Geng J, Gao H, ...
  • Jianlin H (2000). Origin, evolution and genetic diversity of old ...
  • Kijas JW, Townley D, Dalrymple BP, Heaton MP, Maddox JF, ...
  • Lang KDM, Wang Y, Plante Y (1996). Fifteen polymorphic dinucleotide ...
  • Mahrous KF, Ramadan HAI, Abdel-aziem SH, Mordy MA, Hamdan D ...
  • Miller SA, Dykes DD, Polesky HF (1988). A simple sating ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi MR (2011). Application of microsatellite markers for ...
  • Montazeri M, Masoudi AA, Vaez Torshizi R (2016). Microsatellite loci ...
  • Mousavizadeh A, Mohammad Abadi MR, Torabi A, Nassiry MR, Ghiasi ...
  • Nei M (1972). Genetic distances between populations. American Naturalist 106: ...
  • Obreque VL, Coogle PJ, Henney E, Bailey R, Mancilla J, ...
  • R Development Core Team (2014). R: a language and environment ...
  • R Development Core Team (2015). R: A language and environment ...
  • Sasse J, Mariasegaram M, Jahabar MK, Pullenayegum R, Kinne BR, ...
  • Schulz U, Tupac-Yupanqui I, Martínez A, Méndez S, Delgado JV, ...
  • Shahkarami S, Afraz F, Mirhosseini Z, Banabazi MH, Asadzadeh N, ...
  • Tavakoliyan J (1999). Review of Genetic Resources of Native Livestock ...
  • Truxillo C, Hamer R (2007). Multivariate statistical methods: Practical research ...
  • Vijh RK, Tantia MS, Mishra B, Bharani Kumar ST (2007). ...
  • Ward JH (1963). Hierarchical grouping to optimize an objective function. ...
  • Yeh FC, Yang R, Boyle T (1999). PopGene. Version 1.31. ...
  • علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: ۱۳۹۹۵
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    مدیریت اطلاعات پژوهشی

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    مقالات مرتبط جدید

    شبکه تبلیغات علمی کشور

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.