شناسایی جایگاه های رتروترنسپوزونی (IRAP) مرتبط با مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه (.Sclerotinia spp) در آفتابگردان

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 356

فایل این مقاله در 22 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-8-3_007

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

بیماری اسکلروتینیا از بیماری­های قارچی مهم آفتابگردان در ایران می­باشد که باعث کاهش رشد و عملکرد محصول می­شود. در پژوهش حاضر واکنش 100 لاین آفتابگردان روغنی به 6 جدایه قارچ اسکلروتینیا مورد بررسی قرار گرفت و سپس به منظور شناسایی مکان­های ژنی دخیل در مقاومت به بیماری از 128 جایگاه ژنومی تکثیر شده توسط آغازگرهای رتروترنسپوزونی IRAP استفاده شد. نتایج نشان داد که تنوع بالایی در ژر­م­پلاسم مورد مطالعه برای مقاومت به بیماری پوسیدگی اسکلروتینیایی ساقه وجود دارد. بررسی ساختار جمعیت، لاین­های مورد مطالعه را به 3 زیرجمعیت احتمالی (3=K) تقسیم نمود. در تجزیه ارتباط با دو مدل GLM و MLM به ترتیب 14 و 11 مکان ژنومی پیوسته با مقاومت به بیماری (P≤0.01) شناسایی شد. نشانگرهایLTR 1063-65 ،LTR 1064-65  وLTR 1062  با ژن­های کنترل کننده مقاومت به چندین جدایه­ قارچ عامل بیماری پیوسته بودند. نشانگرهای مشترک به دلیل تسهیل گزینش همزمان برای ایجاد مقاومت به چندین جدایه قارچی، می­توانند در برنامه­های به­نژادی آفتابگردان نظیر انتخاب به کمک نشانگر (MAS) بخوبی استفاده شوند. 

نویسندگان

رقیه نجف زاده

گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه و بنیاد ملی نخبگان، تهران و استادیار، گروه گیاهان دارویی، مرکز آموزش عالی شهید باکری، دانشگاه ارومیه، میاندوآب.

رضا درویش زاده

استاد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه و استاد، پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه ارومیه، ارومیه

خدیجه موسی خلیفانی

دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

مسعود ابرین بنا

استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ارومیه، ارومیه

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Amoozadeh M, Darvishzadeh R, Davar R, Abdollahi-Mandoulakani B, Haddadi P, ...
  • Andersen JR, Zein I, Wenzel G, Krützfeldt B, EderJ, Ouzunova ...
  • Anonymous (2010). Agribusiness handbook: sunflower crude and refined oil. FAO/EBRD. ...
  • Bardin SD, Huang HC (2001). Research on biology and control ...
  • inCanada. Canadian Journal of Plant Pathology 23: 88–98. ...
  • Basirnia A, Darvishzadeh R, Abdollahi Mandoulakani B (2016). Retrotransposon insertional ...
  • Basirnia A, Darvishzadeh R, Abdollahi Mandoulakani B, Nabipur A (2014). ...
  • : 19-33 (In Persian). ...
  • Bert P, Jouan F, Tourvieille de Labrouhe D, Seere F, ...
  • Bert PF, Dechamp-Guillaume G, Serre F, Jouan I, Tourvieille de ...
  • Sclero­tinia sclerotiorum and Phoma macdonaldi. Theoretical and Applied Genetics 109: ...
  • Boland GJ, Hall R (1994). Index of plant hosts of ...
  • BoltonMD, Thomma BP, Nelson BD (2006). Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de ...
  • Breseghello F, Sorrells ME (2006). Association mapping of kernel size ...
  • in wheat (Triticum aestivum L.) cultivars. Genetics 172: 1165-1177. ...
  • Cardon LR, Palmer LJ (2003). Population stratification and spurious allelic ...
  • Castaño F, Vear F, Tourvieille de Labrouhe D (1993). Resistance ...
  • Collard BCY, Jahufer MZZ, Brouwer JB, Pang ECK (2005). An ...
  • DadrasAR(2012). Evaluation of genetic diversity of tobacco (Nicotiana tabacum L.) ...
  • Darvishzadeh R (2012). Association of SSR markers with partial resistance ...
  • Davar R, Darvishzadeh R, Majd A (2011). Genotype-isolate interaction for ...
  • Davar R, Darvishzadeh R, Majd A, Ghosta Y, Sarrafi A ...
  • Dewan A, Liu M, Hartman S, Zhang SSM, Liu DT, ...
  • Emamgholi A, Zaefizadeh M, Imani A (2015). The proteomic analysis ...
  • Ershad J (1995). Fungi of Iran. Agricultural Research, Education and Extension Organization ...
  • Evanno G, Regnaut S, Goudet J (2005). Detecting the number ...
  • Falush D, Stephens M, Pritchard JK (2003). Inference of population ...
  • Fusari CM, Di-Rienzo JA, Troglia C, Nishinakamasu V, Moreno MV, ...
  • Doi: 10.1186/1471-2229-12-93. ...
  • Gentzbittel L, Mouzeyar S, Badaoui S, Mestries E, Vear F, ...
  • Ghavami F, Elias EE, Mamidi O, Ansari M, Sargolzaei T, ...
  • Gulya TJ K, Rashid Y, Masirevic SN (1997). Sunflower diseases, ...
  • Hahn V (2002). Genetic variation for resistance to Sclerotinia head ...
  • Hall D, Tegström C, Ingvarsson PK(2010). Using association map­ping to ...
  • Hatami Maleki H, Darvishzadeh R, Mohseni Z (2014). Evaluation of ...
  • Hittalmani S, Huang N, Courtois B, Venuprasad R, Shashidhar HE, ...
  • Jannatdoust M, Darvishzadeh R, Ziaeifard R, Azizi H, Gholinezhad E ...
  • Jun TH, Van K, Kim MY, Lee SH,Walker DR(2008). Association ...
  • Lander ES, Botstein D (1989). Mapping Mendelian factors underlying quantitative ...
  • Liu L, Wang L, YaoJ, Zheng Y, Zhao C (2010). ...
  • Mestries E, Gentzbittel L, Tourvieille de Labrouhe D, Nicolas P, ...
  • Micic Z, Hahn V, Bauer E, Scho¨n CC, Knapp J, ...
  • Micic Z, Hahn V, Bauer E, Schon CC, Melchinger AE ...
  • Micic Z, Hahn V, Bauer E, Melchinger AE, Knapp SJ, ...
  • Mohan M, Nair S, Bhagwat A,KrishnaTG, Yano M, Bhatia CR, ...
  • Price K, Colhoun J (1975). A study of variability of ...
  • Pritchard JK, Stephens MN, RosenbergN, Donnelly P (2000). Asso­ciation mapping ...
  • Pritchard JK, Donnelly P (2001). Case control studies of association ...
  • Rafalski A (2002a). Applications of single nucleotide polymorphisms in crop ...
  • Current Opinion in Plant Biology 5: 94. ...
  • Rafalski JA (2002b). Novel genetic mapping tools in plants: SNPs ...
  • Rojas EV (2014). Physiological, anatomical and molecular characterization of partial ...
  • Rönicke S, Hahn V, Vogler A, Friedt W (2005). Quantitative ...
  • Rostok N, Ramsay L, MacKenzie K, Cardle L, Bhat PR ...
  • Saeed M, Wangzhen G, Tianzhen Z (2014). Association mapping for ...
  • Saharan GS, Mehta N (2008). Economic importance. Sclerotinia Diseases of Crop ...
  • Sahranavard-Azartamar F, Darvishzadeh R, Ghadimzadeh M, Azizi H, Aboulghasemi Z ...
  • in different oily sunflower (Helianthus annuus L.) lines using association ...
  • Sharma R, Meena PD, Verma PR, Saharan GS, Naresh M, ...
  • A review. Journal of Oilseed Brassica 6: 1-44. ...
  • Talukder ZI, Hulke BS, Qi L, Scheffler BE,  Pegadaraju V, ...
  • Tang S, Yu JK, Slabaugh MB, Shintani DK, Knapp SJ ...
  • Tuberosa R, Salvi S, Sanguineti MC, Landi P, Maccaferri M, ...
  • Yu JM, Buckler ES (2006). Genetic association mapping and genome ...
  • Yu J, Pressoir G, Briggs WH, Vroh Bi I, Yamasaki ...
  • Nature Genetics 38: 203-208. ...
  • Yue B, Radi SA, Vick BA, Cai X, Tang S, ...
  • Vollmann J, Rajcan I (2010). Oil Crop Breeding & Genetics, ...
  • Wang M, Jiang N, Jia T, Leach L, Cockram J, ...
  • Zhang Q, Wu C, FY, Ren FY, and Zhang C ...
  • Zhu C, Gore M, Buckler ES, Yu J (2008). Status ...
  • in plants. Plant Genome 1: 5-20. ...
  • نمایش کامل مراجع