شناسایی مولکولی ویروس موزاییک شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) در خردل کاذب (Herschfeldia incana) از ایران

ویروس موزاییک شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) یکی از اعضاء مهم جنس Potyvirus در خانواده Potyviridae و یکی از مهم ترین ویروس های آلوده کننده گیاهان خانواده چلیپاییان (Brassicaceae) می باشد. در فروردین 1391 علایم یک بیماری مشکوک ویروسی مانند موزاییک، کوتولگی و بدشکلی بوته در علف هرز خردل کاذب مشاهده گردید و وجود ویروس موزاییک شلغم با آزمون RT-PCR و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن پروتیین پوششی (coat protein; CP) این ویروس مورد بررسی قرار گرفت. قطعه تکثیر شده (986 جفت باز) ابتدا خالص سازی و سپس تعیین ترادف گردید. آنالیز توالی نوکلیوتیدی وآمینواسیدی پروتیین پوششی، به ترتیب شباهت بین 85/42 تا 89/58 و 91/64 تا 95/12 را با 31 جدایه دیگر این ویروس در دنیا نشان داد. درخت فیلوژنتیکی با نرم افزار MEGA6 و روش Neighbour joining ترسیم شد. نتایج این بررسی فیلوژنتیکی نشان داد که این جدایه ویروس موزاییک شلغم با سه جدایه دیگر از ایران در گروه Basal-B قرار دارند.

کلیدواژه ها:

تحلیل فیلوژنتیکی ، خردل کاذب ، شناسایی مولکولی ، ویروس موزاییک شلغم (TuMV)