بررسی خصوصیات چند شکلی های تک نوکلئوتیدی در ناحیه 5 ژن لاکتوفرین در گاوهای بومی و هلشتاین ایران

زمینه مطالعه: لاکتوفرین، گلیکوپروتیین متصل شونده به آهن، دارای نقش های فیزولوژیکی متعددی می باشد که مهمترین آنها خواص آنتی میکروبی است. از این رو ژن کد کننده این پروتئین می تواند به عنوان ژن کاندیدایی در مقاومت به بیماری ورم پستان در نظر گرفته شود. هدف: بررسی ناحیه ‘5 ژن لاکتوفرین گاو در نمونههای بومی و هلشتاین با استفاده از روش PCR-SSCP و تعیین توالی می باشد. روش کار: برای این منظور از تعداد 50 نمونهگاو بومی و 50 نمونه گاوهلشتاین ماده ژنتیکی استخراج گردید. آغازگرهای لازم جهت تکثیر بخشی از ناحیه ‘5 طراحی و قطعه مورد نظر توسط روش SSCP تعیین ژنوتیپ شد. سپس هر الگوی مشاهده شده تعیین توالی گردید و همترازی توالی جهت شناسایی چند شکلی های تک نوکلئوتیدی صورت گرفت. همچنین،تجزیه و تحلیل این سیلیکو (In silico) جهت تأثیر چند شکلی های تک نوکلئوتیدی بر جایگاه اتصال فاکتورهای رونویسی در ناحیه تکثیر شده صورت گرفت. نتایج: در این تحقیق، در تمام نمونه های مورد بررسی 3 الگویواضح B, A)SSCP و C) برای قطعه تکثیر شده مشاهده شد که در گاوهای بومی تنها هاپلوتیپ C آشکار گردید. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی ها نشان داد که جایگزینی T با G در جایگاه 602 منجر به ایجاد اتصالی برای فاکتور رونویسی AML-1 گردید. از طرف دیگر، جایگزینی T با C در جایگاه 586 جایگاه اتصال فاکتور رونویسی AML-1 را منسوخ می کند. نتیجه گیری نهایی: بنابراین، جهت استفاده از ژن لاکتوفرین به عنوان نشانگر مقاومت به بیماری ورم پستان در گاوهای شیری، بررسی این چند شکلی ها از نظر تأثیر بر فرآیند رونویسی ژن، همچنین ارتباط آن با تعداد سلول های سوماتیکی شیر امری ضروری می باشد.

کلیدواژه ها:

گاو ، ناحیه '5 لاکتوفرین ، هاپلوتیپ ، چند شکلی تک نوکلئوتیدی ، فاکتور رونویسی