طبقه بندی مولکولی و تجزیه و تحلیل شجره ای ژنوتایپ های LPS1-8 جدایه های پاستورلا مولتوسیدا ی طیوری در ایران بااستفاده از روش LPS- PCR typing

پاستورلا مولتوسیدا یک پاتوژن گرم منفی و مهم در دامپزشکی می باشدکه براساس آنتی ژن پلی ساکاریدی به 16 سروتایپ بااستفاده از روش ژل دیفیوژن تقسیم میشود. در این مطالعه روش LPS PCR typing برای تایپینگ مولکولی وآنالیز فیلوژنیک ژنوتایپ های 8 - LPS1 جدایه های پاستورلا مولتوسیدا از طیور ایران به کار گرفته شد. در این مطالعه 30 جدایه طیوری پاستورلا مولتوسیدا در محیط کشت اختصاصی ) BHI ( کشت داده شده و DNA ژنومی آنها به روش جوشاندن استخراج گردید. شناسایی به روش بیوشیمیایی و مولکولی انجام گردید. ژنوتایپینگ لیپوپلی ساکاریدی به روش LPS-PCR و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی انجام شد. محصولات PCR از هر یک از ژنوتایپ ها تعیین سکانس شده و ارتباط آن ها با توالیهای موجود در Gen bank مقایسه گردید. تمام ایزوله های مورد بررسی با روش LPS -PCR قابل تیپ بندی بودند. از بین جدایه ها، 18 جدایه دارای ژنوتیپ 60( L1 درصد( و 4جدایه دارای ژنوتیپ 13/33( L2 درصد( و 5 جدایه دارای ژنوتیپ 16/66( L3 درصد( و 2جدایه دارای هرسه ژنوتیپ 6/66( L3,L2,L1 درصد( و 1جدایه دارای دو ژنوتیپ 3/33( L3,L2 درصد( بودند. هیچکدام ایزوله ای با ژنوتیپ های دیگر شناسایی نشدند ژنوتیپ های L8-L4 در بین جدایههای مطالعه شده شناسایی نشدند. در مقایسه نتایج توالی نوکلیوتیدی جدایه های بومی ایران با جدای ههای موجود در Genbank اختلافات قابل توجه وجود داشت.روش LPS PCR typing نشان داد که سه ژنوتیپ L2 ,L1 و L3 پاستورلا مولتوسیدا در جدایه های بومی ایران حضور دارند. این تحقیق نشان داد که روش LPS- PCR یک سیستم تایپینگ مناسب برای افتراق بین جدایه های پاستورلا مولتوسیدا میباشد

کلیدواژه ها:

پاستورلا مولتوسیدا ، طیور ، ژنوتایپینگ ، LPS- PCR