کاربرد دینامیک مولکولی در طراحی پیشرفته فرآورده های بیولوژیک و مطالعه پروتئین اجرام عفونی

شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) دانشی است که از ترکیب علوم زیستی، شیمی و روش ها و الگوریتم های متنوع رایانه ای-ریاضیاتی استفاده می کند. این تکنیک جهت طراحی پیشرفته دارو، واکسن، آنتی بادی، پروتئین یا پپتید و سایر ماکرو و میکرو مولکول های اجرام عفونی یا غیر عفونی و مواد بکار برده می شود. شکوفایی و تحول روزافزون این زمینه از علم بیوانفورماتیک در طراحی و ساخت فوق پیشرفته فرآورده های بیولوژیک و دارویی، به شبیه سازی برون تنی پدیده های زیستی مشابه با شرایط درون تنی کمک شایانی نموده است. آشنایی هر چه بیشتر با این علم از نقطه نظر کاربردی و تولیدی برای محققین شاغل در دانشگاه ها و پژوهشگاه های علوم پزشکی و دامپزشکی می تواند سبب آشنایی هر چه بیشتر آن ها با این حوزه مترقی از علم شده و در بهبود پژوهش ها و تولیدات مفید باشد. از سوی دیگر، به کارگیری این علم می تواند به صورت قابل ملاحظه ای موجب صرفه جویی در هزینه ها و زمان شود. در این مقاله در درجه نخست به معرفی و تقسیم بندی دینامیک مولکولی از دید کلی پرداخته شده است و سپس مطالب پایه ای و مزایای دینامیک مولکولی، روش ها و برنامه های مورد استفاده در آن مورد بررسی قرار گرفته است. در پایان به کاربرد این روش نوین در تحقیقات ایمونوانفورماتیک (طراحی واکسن، کیت، آنتی بادی، ادجوانت و غیره) و کموانفورماتیک (طراحی دارو) و همچنین بررسی اجرام عفونی پرداخته شده است.

کلیدواژه ها:

دینامیک مولکولی ، ایمونوانفورماتیک ، کموانفورماتیک ، بیماری های عفونی