بررسی ویژگی سوبسترایی آنزیم آلژینات لیاز بدست آمده از Pseudomonas aeruginosa s21 در مقایسه با توالی های آمینواسیدی و ژنی سویه های مختلف این باکتری

آلژینات پلی ساکاریدی خطی از بتا-دی- مانورونات (M) و/ یا آلفا-ال-گولورونات (G) با پیوند کووالانسی 4-1 است و از جملهمواد اصلی تشکیل دهنده بیوفیلم باکتری P. Aeruginosa و یکی از علل مقاومت آنتی بیوتیکی آن می باشد. آلژینات لیازهای مختلف، سوبستراهای اختصاصی متفاوتی شامل آلژینات حاوی بلوک G، بلوک M و بلوک MG را شناخته و تخریب می کنند. پیدا کردن ترادف های نوکلیوتیدی در ژن algL مربوط به باکتری P. aeruginosa می باشد که با ویژگی سوبسترایی این آنزیم در ارتباط هستند.ارزیابی فعالیت آنزیم بر بلوک های M, G و MG با روش TBA انجام گرفت. هم چنین پایگاه های اطلاعاتی NCBI و Uniprot و سرور Clustalw برای پیدا کردن ترادف های نوکلیوتیدی و آمینواسیدی مربوط به ویژگی سوبسترایی آلژینات لیازها استفاده شدند.آنزیم آلژینات لیاز باکتری P. aeruginosa s21 ترجیحا بر بلوک MG موثر است. آمینواسیدهای کاملا حفاظت شده ای در همه ژن های algL مربوط به سویه های P. aeruginosa وجود دارد. هم چنین، همترازی های بین ژن های algL مربوط به آلژینات لیازهای با ویژگی سوبسترایی متفاوت، اختلافاتی را در توالی های مربوطه نشان دادند. ترادف های آمینواسیدی و اسید نوکلییکی مرتبط با ویژگی سوبسترایی متفاوت آلژینات لیاز ها مشخص گردید.بنابراین می توان به وسیله تغییرات در این نواحی آنزیم هایی با ویژگی سوبسترایی دلخواه ایجاد کرد و به این ترتیب آلژیناتهای مختلف را در انواع بیوفیلم های باکتری های P. aeruginosa تخریب کرد و حساسیت آنتی بیوتیکی آن را افزایش داد.

کلیدواژه ها:

، Pseudomonas aeruginosa ، آلژینات لیاز ، ویژگی سوبسترایی