مروری بر روش های محاسباتی در حاشیه نگاری هستی شناختی ژن

امروزه با پیشرفت ابزارهای اکتشاف توالی در زیست شناسی، بدست آوردن داده های زیستی دیگر محدودیت علمی محسوب نمی شود. حال با رشد روز افزون حجم داده های زیستی، گلوگاه جدید علم زیست شناسی ذخیره و آنالیز این داده ها است. یکی از پایگاه های داده ی مهم در حوزه ی زیست شناسی و بیوانفورماتیک هستی شناخی ژن است. در هستی شناختی ژن، به توضیحات پیرامون عملکرد ژن خاص، محل تاثیر آن، و محصولات ژنی حاشیه نگاری ژن می گویند. در حقیقت، حاشیه نگاری ژن شامل نمونه هایی تجربی و واقعی از مفاهیم زیستی با استناد به نتایج آزمایش ها و محاسبات آماری دقیق است.محققان با داشتن حاشیه نگاری ژن دسترسی به دانش و اطلاعات پیرامون ژن خاص پیدا می کنند. در حالی که توسعه ی حاشیه نگاری ژن، در ابتدای امر، به صورت دستی و توسط متخصصین انجام می شده است. امروزه، روش های الگوریتمی و آماری برای خودکارسازی فرایند توسعه معرفی شده است. مقاله حاضر مروری بر متدها و الگوریتم های داده کاوی و هوش مصنوعی کاربردی در حوزه ی حاشیه نگاری ژن است.

کلیدواژه ها:

هستی شناختی ، هستی شناختی ژن ، حاشیه نگاری ، تبارزایشی ، هم ترازسازی توالی