مطالعه بیوانفورماتیکی ژن پیروفسفاتاز و اکوئلی آرابیدوپسیس AVP1

نظر به وسعت زمین های شوردرکشورکلون کردن شناسایی و یا معرفی ژنها و تولید گیاهان تراریخته مقاوم ضروری است ژن پیروفسفاتاز و اکوئلی آرابیدوپسیس کدکننده پمپ پروتئینی واکوئلی تک واحدی با انتقال و جمع اوری H+ درداخل واکوئل یک شیب الکتروشیمیایی ایجاد می کند انتی پورترNa+/H+ باجابجایی Na+ به درون واکوئل تحمل گیاه را دربرابر شوری افزایش میدهد هدف ازمطالعه حاضرارایه اطلاعات کاربردی برای کلون کردن ژن AVP1 همچون توالی ژنومی مکان کروموزومی ژن های دخیل درمسیر متابولیکی و توالی پرایمرهای اختصاصی و همچنین ویژگیهای بیوفیزیکوشیمیایی پروتئین دامنه ها همولوگ ها و تجزیه کلاستر این پروتئین می باشند ژن AVP1 مستقر درکروموزوم شماره یک 3743 نوکلئوتید و 770 امینواسید دارد ویژگیهای اصلی بیوفیزیکوشیمیایی پروتئین همچون ضریب خاموشی درطول موج 280نانومتر نیمه عمرپروتئین درمحیطهای in vitro in vivo و شاخص ناپایداری به ترتیب 73395 M-1CM-1 30 و بیش از20ساعت و 22/4 محاسبه شدند این پروتئین دارای 13 ناحیه درون غشایی می باشد هضم به وسیله سه انزیم های تجاری دریک سه و 36نقطه برش ایجادکردند دودامنه h_PPase hppA برای این پروتئین مشخص و سه ژن ORF294 ، AT5G47030 ٍ ATP6-2 درمسیربیوشیمیایی شناسایی شدند پروتئین های هومولوگ تجزیه کلاستر آنها و رسم دندگرام نشان داد با گیاه هالوفیتThellungiella دریک زیرخانواده قرار میگیرد

کلیدواژه ها:

ژن پیروفسفاتازواکوئلی ، بیوفیزیکوشیمیایی ، پروتئین های هومولوگ ، تجزیه کلاستر