اختصاصیت ایمنی زائی پروتئین بیوفیلمی Acinetobacter baumannii - مطالعه ی بیوانفورماتیکی

ءAcinetobacter baumannii یک پاتوژن مهم و عامل ایجاد بسیاری از عفونت های بیمارستانی است که امروزه به علت توانایی بقا در محیط های بیمارستانی و مقاومت به طیف وسیعی از آنتی بیوتیک ها مورد توجه قرار گرفته است. پروتئین بیوفیلمی (Biofilm-associated protein, Bap) تاثیر بسزایی در تولید بیوفیلم توسط این میکروارگانیسم و در نتیجه عفونت زایی و مقاومت آن دارد. این پروتئین از هفت الگوی تکراری (A-G) تشکیل شده است. این پژوهش باتوجه به اهمیت این پروتئین، برای انتخاب نواحی مواثر در ایمنی زایی علیه A. baumannii طراحی شده است. بسیاری از شاخص های مهم در ایمنی زایی در توالی پروتئین Bap با استفاده از نرم افزارهای مختلف بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت. به این منظور توالی پروتئین به قسمت های مختلف تقسیم بندی شد و نتایج با هم مقایسه شدند. چهار ناحیه از Bap با توجه به محتوای توالی تکراری آنها، از بین نواحی آنتیژنیک پروتئین، برای تجزیه و تحلیل ایمونوانفورماتیکی بیشتر انتخاب شدند. در چهار ناحیه انتخاب شده از Bap تمامی واحدهای تکراری (به غیر از D) و نیز آرایش های خاص آنها دیده می شود. شاخص های آنتیژنیک، حلالیت و پایداری این نواحی نشان می دهد که این قسمتها از پروتئین، می توانند موضوع مناسبی برای آزمایش های عملی باشند. می توان انتظار داشت که آنتیبادی علیه این قسمت ها، تولید بیوفیلم را در A. baumannii مهار کنند.

کلیدواژه ها:

بیوفیلم پروتئین ، ایمنی زایی ، بیوانفورتیک ، Acinetobacter baumannii