شناسایی ژنهای درگیر در گامتوفیت ماده آرابیدوپسیس با استفاده از آنالیز شبکه های ژنی

اگرچه گامتوفیت ماده در آنژیوسپرم شامل هفت سلول میشود، اما دارای شبکه بیولوژیکی پیچیدهای است. در این تحقیق با استفاده از دادههای ریزآرایه گامتوفیتهای ماده و به کار گیری آنها درون دیتابیس آرابیدوپسیس، یک نقشه اثر متقابلی پروتئین - پروتئین از گامتوفیت ماده بر اساس فرآیندهای بیولوژیکی و عملکرد مولکولی پروتئینها ساخته شد. گروههای کارکردی و بیولوژیکی از شبکه، نظیر فیتوهورمونها، دفاع گیاه، مرگ سلولی، حاملها و هیدرولیززها مورد تحقیق قرار گرفتندتا اعضای مهم و حیاتی مشخص گردند. به طور قابل توجهی متوجه ارتباطات جدید و مهمی میان ژنهایی نظیر ATP disulfate isomerase و Pathogenesis-related Protein 4, ECA3, dihydroflavonol reductase شدیم. موقعیتهای ژنهای با بیان بالا و پایین گامتوفیت ماده در شبکه و رابطه آنها با مسیرهای بیولوژیکی نمایش داده شد.

کلیدواژه ها:

گامتوفیت ماده ، اثرمتقابل پروتئینها ، شبکه ، آرابیدوپسیس