ارزیابی تنوع ژنتیکی لاینهای گندم نان توسط نشانگرهای IRAP و REMAP

توزیع و وفور وسیع رتروترنسپوزونها در نواحی یوکروماتینی کروموزو مها و چندشکلی درجی آنها در بین و داخل گون ههای گیاهی، استفاده از آنها را به عنوان یکی از ابزارهای مهم مطالعات ژنومیکس گیاهی ممکن میسازد. به منظور مطالعه تنوع ژنتیکی 51 لاین گندم هگزاپلوئید از 28 آغازگرIRAP(Inter-retrotransposon amplified polymorphism) و REMAP (Retrotransposon microsatellite amplified polymorphism)که بر اساس رتروترنسپوزونهایWis2 -1A ، Daniela Fatima و Wilma-Bagy-2از گندم وSukkula از جو طراحی شده بود استفاده شد. الگوی نواری بر اساس آغازگرهای موردمطالعه نشان داد که خانوادههای مورد استفاده در ژنوم گندم فعال بوده و در داخل همدیگر بصورت سر به سر، سر به دم و دم بهدم درج میشوند. 10 آغازگر دارای الگوی باندی واضح، 137 مکان ژنی تولید نموده که 91 درصد آنها ( 125 مکان) چند شکل بودند. سهم آغازگرهای IRAPREMAPاز مکانهای چندشکل بترتیب 51 و 74 بود. تجزیه کلاستر به روشUPGMA مبتنیبر ضرایب تشابه دایس، لاینهای مورد مطالعه را در گروههای متفاوتی قرار داد. بیشترین و کمترین تشابه ژنتیکی بین لاینها به ترتیب 0.93 ( بین لاینهای 25 و 164 ) و 0.47 ( بین لاینهای 151 و 1661 ) بود. نتایج حاصله نشان داد که نشانگرهایIRAP و REMAPتوسعه یافته بر اساس رتروترنسپوزونهای فعال میتوانند به عنوان ابزار نسبتا جدیدی در مطالعه تنوع ژنتیکی و سایرزمینههای مرتبط در گندم و حتی سایر گونههای گیاهی استفاده شوند.

کلیدواژه ها:

گندم هگزاپلوئید ، رتروترنسپوزونهای فعال ، تشابه ژنتیکی