بررسی امکان استفاده از ناحیه تکراری trnA-trnIبه عنوان محل پذیرش عمومی تراژن در ژنوم کلروپلاستی گونههای مختلف گیاهی

اخیراً تلاشهای متمرکز بر روی کسب و آنالیز توالیهای ژنتیکی جلبکهای سبز، حجم وسیعی از اطلاعات بیوانفورماتیکی را تولید نموده است که فرصت مغتنمی را در پیشرفت علوم زیست شناسی بخصوص در ژنومیک مقایسهای و کارکردی ایجاد کرده است. در این مقاله سعی بر این است که با یک بررسی مقایسهای در ژنوم کلروپلاستی شاخهChlorophytaو مقایسه آن با گیاهان مدل آرابیدوپسیس و تنباکو، ناحیه بین ژنی مناسبی برای ورود کاستهای ژنی نوترکیب معرفی نمود که با بهرهگیری از یک تکرار مناسب و پروموتور قوی بالادست، بتوان میزان بیان مناسبی از تراژن را در کلروپلاست گیاه بدست آورد. در این مطالعه، آنالیز توالی ژنومهای کلروپلاستی با استفاده از نرم افزارهایBioedit و PAUP انجام شد و نمودارهای فیلوژنتیک و ماتریس فواصل بدست آمد. نتایج نشان داد که توالی بین ژنی trnA-trnIواقع در ناحیه تکراری اغلب ژنومهای کلروپلاستی از چنین توانایی برخوردار می باشد، اما به دلیل تفاوت موجود در این ناحیه در گونههای مختلف، استفاده از سازه ژنی اختصاصی هر گونه برای افزایش عملکرد انتقال ژن توصیه میشود.

کلیدواژه ها:

مهندسی کلروپلاست ، جلبک .trnI ، trnA