توسعه نشانگرهای REMAPدر یونجه های زراعی (Medicago Sativa L.) جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 477
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0548
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
چندشکلی حاصل از تکثیر نواحی بین توالیهای ریزماهواره و رتروترنسپوزون (REMAP)از نشانگرهای مبتنی برPCRساده و جدیدی است که مناطق رتروترنسپوزونی و ریزماهوارهای را مورد هدف قرار می دهد . در این مطالعه به منظور توسعه نشانگرهای رتروترنسپوزونیREMAPجهت مطالعه تنوع ژنتیکی در یونجه های زراعی، 48 ترکیب آغازگری REMAPحاصل از خانواده های رتروترنسپونیTps12a و LORE2 ،LORE1 ،Tms1Ret1 و توالیهای ریزماهواره برای ارزیابی تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیتی هشت جمعیت ( 80 ژنوتیپ) یونجه زراعی مورد استفاده قرار گرفت. 14 ترکیب آغازگری مکان های چندشکل و قابل نمره دهی تولید کردند. در کل با استفاده از 14 ترکیب آغازگریREMAP 119 مکان تکثیر شد که 2 مکان چندشکل بودند. تجزیه کلاستر به روشUPGMA و بر اساس ضرایب فاصله ژنتیکی نی جمعیت ها را در سه خوشه اصلی قرار داد. فاصله ژنتیکی بین جمعیت ها از 0.048 (قره یونجه ملک کندی و بغدادی ) تا0.124 (بغدادی و آذربایجان اردوبار) متغیر بود. تجزیه واریانس مولکولی، تنوع ژنتیکی زیادی را در درون جمعیت ها ( 94 درصد) نسبت به بین جمعیت ها ( 6 درصد) نشان داد. درصد مکانهای چند شکل در جمعیت ها از 79.03 (جمعیت محلی اصفهان ) تا 78/71 (جمعیت قره یونجه ارومیه) متغیر بود و میانگین هتروزیگوسیتی برای جمعیت های مورد مطالعه برابر 0.267 بود. نتایج نشان داد که تمام خانواده های رتروترنسپونی مورد استفاده در نزدیکی ریزماهواره ها در ژنوم یونجه حضور داشته و میتوانند به عنوان نشانگرهایREMAPدر یونجه استفاده شوند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
یاسر پیری کشتیبان
دانشکده کشاورزی دانشگاه آزاد اسلامی واحد تبریز
بابک عبدالهی مندولکانی
دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه
رضا درویش زاده
دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه
مراد جعفری
دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :