مقایسهی ژن اندوگلوکاناز دو جدایه دارای فعالیت بالا و پایین سلولازی در قارچ Trichoderma longibrachiatum

سلولز فراونترین هیدروکربن قابل تجزیه در طبیعت است و قارچها مهم ترین نقش را در تجزیه ترکیبات سلولزى بر عهده دارند. در این تحقیق توانایی تولید سلولاز درچندین ایزوله مختلف قارچی که از مزارع شمال کشور جداسازی شده بودند، درمحیط پایه کربوکسی متیل سلولز بررسی شد. میزان قند و پروتیئن آزاد شده توسط اسپکتوفتومتر در محیط اندازهگیری و دو برای ردیابی (SDS-PAGE) بر اساس پروفایل پروتئینی Trichoderma longibrachiatum ایزوله پرکار و کم کار درگونهو توالییابی ژن اندوگلوکاناز انتخاب شد، ژنهای توالییابی شده دارای همولوژی % 98 با ژن اندوگلوکاناز در قارچهای هم گونه 1386 بود که پروتینی با 462 اسیدآمینه را کد می کرد و در ایزوله کم کار bp خود بوده اند، این ژن در ایزوله پرکار به طول1274 و پروتئنی با 424 اسید آمینه را کد میکرد.همچنین دو توالی در 16 نقطه دارای اختلاف در نوکلئوتید بودند bp دارای شده است. سپس پروسایتها و EG که در 8 نقطه، تفاوت در نوکلئوتید باعث تغییر در سطح اسید آمینه در توالی پپتیدی دومینها درتوالی پروتئنی دو ایزوله بررسی گردید. دو توالی پروتئنی دارای دو دومین مشابه گلیکوزیل هیدرولاز و دامنه خطی CBM1 (carbohydrate binding type- سلولاز بودند، اما ایزوله با تولید سلولاز بالا دارای یک پروسایت بیشتر با نام ( 1 می باشد که قارچ با تولید سلولاز پایین این سایت را دارا نبود. این سایت مسئول ایجاد سلولاز در قارچها domain signature NCBI می باشد که این مورد بسیار حائز اهمیت است. همچنین توالی ژن اندوگلوکاناز ایزوله دارای فعالیت باالا در بانک اطلاعاتی ثبت شد

کلیدواژه ها:

اندوگلوکاناز ، فعالیت سلولازی ، پروسایت ، Trichoderma longibrachiatum