کاربرد الگوریتم کلنی مورچه (ACO) در نقش هیابی QTL های تولید گندم

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 608

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_0756

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

نقشه های ژنتیکی در اصلاح نباتات و مکان یابی های 1 صفات کمی گیاهان زراعی اهمیت زیادی داشته و با معرفی QTL به وفور در گیاهان زراعی استفاده شده اند. با افزایش جایگاه های ژنتیکی، دشواری تعیین ترتیب 3 TRAP و SSR نشانگرهای 4 بخوبی حل شده که در نقشه یابی ژنوم با اعمال آزمون بوتستراپ (ACO) مطلوب آنها با راهکار مدرن الگوریتم کلنی مورچه بکار گرفته می شود. در این تحقیق، نقشه های لینکاژی مجزائی درجمعیتی از 96 لاین دبل هاپلوئید گندم برای 35 جفت آغازگر تهیه و جهت Joinmap با الگوریتم کلنی مورچه ترسیم و نقشه ادغام شده، به کمک برنام ه TRAP و 21 جفت آغازگر SSR های صفات عملکرد دانه و شاخص برداشت، مهمترین صفات اقتصادی گندم، استفاده شد. بر این اساس طول QTL شناسایی بر QTL 1454/93 بوده و 15 کروموزوم منوپلوئید را دربر گرفت. صفت عملکرد در سال 1385 دارای دو cM نقشه بدست آمده هایی بزرگ اثر و کوچک اثر بوده و QTL 7 بوده که بهمراه شاخص برداشت در اغلب سال ها دارای A 6 و B روی کروموزوم های 2 با دو A بود. ب رای شاخص برداشت، جایگاه کروموزوم (AAE) و اثر متقابل اپیستازی و محیط (AA) نیز دارای اپیستازی 5 اثر متقابل نشان داده و اپیستازی اول با سال دوم و اپیستازی دوم با سا لهای دوم و چهارم A جایگاه دیگر بر روی کروموزم 1 درصد از تنوع این صفت مهم را توجیه نمودند. این اطلاعات می توان د در / 5 و 67 /6 ،3/ اثر متقابل نشان داده که بترتیب 86 کارهای اصلاحی همانند کلون کردن و انتقال ژن های این صفات بکار رود.

نویسندگان

علی آرمینیان

دانش آموخته دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد

سعداله هوشمند

عضو هیئت علمی، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد

رضا امیری فهلیانی

عضو هیئت علمی، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Arminian, A. 2010. Evaluation of Agronomic traits and mapping some ...
  • Arminian, _ Amiri, Fahliani, R., Musavi, S. 2010. A fast ...
  • Carlborg, O., Haley, C.S. 2004. Epistasis: too often neglected in ...
  • Cheema, J., Dicks, J. 2009. Computational approaches and software tools ...
  • Chu, C.-G., Xu S.S., Friesen, T.L., Faris, J.D. 2008. Whole ...
  • Dorigo, M., Stitzle, T. 2004. Ant Colony Optimization, MIT Press, ...
  • Gao, Y.M., Zhu, J. 2007. Mapping QTLs with digenic epistasis ...
  • Hu, J., Vick, B.A. .2003. TRAP (target region amplification polymorphism): ...
  • Iwata, H. 2006. Constructing genetic linkage maps by ant colony ...
  • Iwata, H., Ninomiya, S. 2006. Antmap: constructing genetic linkage maps ...
  • Lorz, H., Wenzel, G. 2005 .Molecular Marker Systems in Plant ...
  • Maccaferri, M., Sanguineti M.C., Corneti S., Ortega J.L.A., Salem M.B., ...
  • Sturtevant, A.H. 1913. The linear arrangement of six sex-linked factors ...
  • Wang, S., Basten, C.J., Zeng Z.-B. 2007. Windows QTL Cartographer ...
  • Yang, J., Hu, C.C., Ye, X.Z., Zhu, J. 2005. QTLNetwork ...
  • نمایش کامل مراجع