تعیین تنوع ژنتیکی جدایه های Fusarim solani عامل پوسیدگی ریشه و طوقه گوجه فرنگی با استفاده از نشانگر ISS و مقایسه آن با VCG
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 340
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_1028
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
تنوع ژنتیکی 23 جدایه قارچ F. Solani با استفاده از نشانگر ISS بررسی و نتایج با گروه های سازگار رویشی جدایه ها مقایسه شد. بعد از استخراج DNA قارچ و انجام PCR، به کمک آغازگرهای ISS باندهای واضح در تصاویر ژل مشخص شدند. 81 باند قابل رتبه بندی در دامنه 350 - 3000 جفت باز در 23 جدایه مورد بررسی تکثیر شد. از 10 جایگاه شناسایی شده توسط این آغازگر، در 9 جایگاه چندشکلی مشاهده شد. بهترین روش گروه بندی با ضریب جاکارد و روش تجزیه خوشه ای UPGMA مشخص شد. برش دندروگرام در سطح تشابه 88% جدایه ها را به 12 گروه تقسیم کرد که از a تا l نامگذاری شدند. گروه های c و e هر کدام دو عضوی، گروه d سه عضوی، گروه f چهار عضوی، گروه h پنج عضوی و بقیه تک عضوی بودند. نتایج این بررسی، آزمون VCG جدایه ها را که قبلا انجام شده بود، تا حدی تایید کرد ولی با مناطق جغرافیایی محل جمع آوری جدایهها ارتباطی یافت نشد. همچنین این نشانگر نتوانست بخوبی تفاوت بین جدایه ها را مشخص کند و تنوع ژنتیکی پایینی از این قارچ نشان داد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محمدرضا پروین
گروه گیاهپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز
رضا فرخی نژاد
گروه زراعت واصلاح نباتات دانشگاه شهید چمران اهواز
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :