شناسایی و بررسی یک ارگونات نادر در ژنوم گیاه شلغم (Brassica rapa)

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 580

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0159

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

یکی از مهمترین پروتئین های که در بحث خاموشی ژن و ایجاد small RNA ها نقش فعال و بسزایی دارند، پروتئین های آرگونات می باشند. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی پروتئین های آرگونات موجود در گیاه شلغم با استفاده از ابزار و روش های بیوانفورماتیکی بود. توالی های پروتئین های آرگونات گیاه شلغم، از پایگاه اطلاعاتی موردنظر دریافت شد، سپس همردیفی توالی های، ساختار سه بعدی، دامنه ها و درخت فیلوژنی این پروتئین ها مشخص شد و در انتها خصوصیات بیشتری از این پروتئین ها مورد بررسی قرار گرفت. این تحقیق نشان داد که شلغم دارای 13 پروتئین آرگونات می باشد. پروتئین های آرگونات موجود در گیاه شلغم مانند سایر گیاهان به طور کلی دارای سه دامنه اصلی به نام های PAZ, MID و PIWI می باشند که پروتئین آرگونات شماره 5 شلغم علاوه بر سه دامنه ی اصلی ذکر شده دو دامنه ی دیگر به نام های CIMS_N_terminal_like و CIMS_C_terminal_like را نیز دارا می باشد، که وجود این دامنه ها در پروتئین های آرگونات یک گیاه برای اولین بار گزارش می شود و تا به حال در سایر گیاهان و حیوانات گزارش نشده است.

نویسندگان

وحید مرادی وحدت

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه کردستان

مریم مرادی وحدت

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه بین المللی قزوین

لیلا اکبری

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه شهرکرد

خالد میرزایی

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه شهرکرد

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • Cartea M.E, et al (2011) Phenolic Compounds in Brassica Vegetables ...
  • Mallory A. et al (2009) Redundant and Specific Roles of ...
  • Morel J.B, et al (2002) Fertile hypomorphic ARG ONAUTE (ago1) ...
  • Li M . et al (2007) Production of Partial New-typed ...
  • Parker J. S, et al (2006) Argonaute: a scaffold for ...
  • Peters L. Meister M (2007) Argonaute Proteins: Mediators of RNA ...
  • Tahmasebi A. A, Zangane M (2010) Interaction of RNA silencing ...
  • Wang Y. et al (2011) A sequence -based genetic linkage ...
  • Vaucheret H (2008) Plant ARG ONAUTE S, Trends in Plat ...
  • Tamura K, Dudley J, Nei M & Kumar S (2007) ...
  • Thompson J.D. Higgins D.G. and Gibson T.J (1994) CLUSTAL W ...
  • نمایش کامل مراجع