بررسی فیلوژنتیکی جدایه های سودوموناس فلورسنت جداشده از ریزوسفر گندم

دراین تحقیق 60 نمونه باکتری سودومونادهای فلورسنت از محیط فرا ریشه (rhizospher) که از مناطق گندم کاری های استان های تهران، قزوین، گلستان، اردبیل، زنجان، مرکزی واصفهان جمع آوری شده بود،جداسازی و مورد بررسی قرار گرفت. با توجه به آزمون های بیوشیمیایی، فیزیولوژیکی و مورفولوژیکی، ویژگی های جدایه های انتخاب شده با بیوارهای L،III, V گونه Pseudomonas fluorescens و P. protegens بیشترین قرابت و مطابقت را داشت. شناسایی نمونه های باکتری براساس خصوصیات بیوشیمیایی و براساس داشتن ژن تولید کننده ی آنتی بیوتیک 2و 4- دی استیل فلوروگلوسینول PhlD با استفاده از PCR انجام شد. تعیین توالی ژن rpoB درتعدادی از جدایه های متعلق به دو گروه نشان داد که استریت های 27،26،19 و 30 با 98% به گونه P. protegens و استرین های 15،9،6،1 و 17 با 96/6% به گونه های P.fluorescens ،اP. protegens و حتی P. chlororaphisشبیه بودند ولی این شباهت درحدی نبود که به توان به عنوان گونه قطعی تایید کرد.

کلیدواژه ها:

اPseudomonas fluorescens ، ژن تولید کننده آنتی بیوتیک 2و 4- دی استیل فلوروگلوسینولPhlD ، تعیین توالی ژن rpoB