اولین گزارش ارپوسیدگی جوانه انتهایی نی(Arundo donax) ناشی از Pectobacterium sp

نی یکی از اعضای خانواده گندمیان( Poaceae) است که بیشتر در حاشیه مزارع برنج، مردابها و حاشیه رودخانه ها رشدمی کنند. در بهار و اواسط تابستان 1390 تعدادی نمونه با علائم پوسیدگی ساقه و جوانه انتهایی از مازندران جمع آوری شد. از نمونه ها باکتری Pectobacterium sp براساس خصوصیات فنوتیپی شناسایی شد. نمونه ها درتکثیر ژن پکتین لیاز(Pel) با استفاده از آغازگرY1/Y2 مثبت بوده و به جنس Pectobacterium تعلق داشتند. دو جدایه با استفاده ازآغازگرژن پلیمر از ریبوزومی زیر واحد بتا (rpoB)تکثیر و در هردو جهت سنس وآنتیسنس تعیین توالی شدند. توالی های بدست آمده با استفاده از نرم افزار Seqman اصلاح و بابکارگیری نرم افزارBLAST (NCBI) با توالی های موجود در بانک ژن هم ردیف شدند. توالی های نی بادیگر توالی ها با استفاده از الگوریتم ClustalWهمردیف شد و به روش Neiborjoining در نرم افزار Mega5.1 دندروگرام مربوطه ترسیم گردید. نتایج نشان داد که جدایه های نی با گونه های مختلف Pectobacterium شباهت داشته ولی بطور قطعی در هیچ گونه شناخته شده ای قرار نگرفت. این جدایه ها احتمالا متعلق به گونه جدیدی از پکتو باکتریوم باشند.