پیش گویی ساختار دومم و سوم پروتئین ompc در نایسریا مننژیتیدیس
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 515
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0842
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
باکتری نایسریا مننژیتدیس (مننگوکوک) باکتری گرم منفی شایعی است که علت اصلی مننژیت باکتریایی کودکان می باشد OMPC ترکیبی پروتئینی در غشای خارجی این باکتری است که بعنوان یک پروتئین حامل (carrier) در غشا بوده که نقش مهمی را در نقل و انتقال مواد در عرض عشای سلول بازی می کند . پیش بینی می شود تولید آنتی بادی بر علیه این پروتئین خارجی سلولی بتواند مسیر جذب مواد غذایی ضروری مورد نیاز باکتری را مسدود کرده و سبب مرگ باکتری گردد . ساختار دوم و سوم پروتئین برای آنتی بادیها و سلولهای B اهمیت دارد و اکثر اپیتوپهای سلول B در ساختار پیجهای بتا (Betaturns ) قرار دارند . در انتخاب بخشی از پروتئین که دارای خاصیت اپیتوپی بوده و بتوان آن را به عنوان واکسن انتخاب نمود ، بنابراین ساختار دوم و سوم پروتئین می تواند یکی از معیارهای گزیسش باشد . از ابزارهای بیوانفورماتیکی می توان برای پیش بینی ساختار دوم بهره برد . نرم افزار Phyre2 برای پیش گویی ساختار دوم و سوم پروتئین و نرم افزار PROSA برای ارزیابی ساختار سه بعدی پیش گویی شده مورد استفاده قرار گرفت . Z score ساختار پیش گویی شده در محدوده ساختار های کریستالوگرافی شده بانک PDB ارزیابی گردید.
کلیدواژه ها:
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :