بررسی بیوانفورماتیکی ژن MDHAR از گیاه آلوروژوس لیتولاریس
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 664
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0867
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
مونودهیدروآسکوربات ردوکتاز یکی از آنزیمهای مهم مسیر آنتیا کسیدانت برای سمیت زدایی رادیکالهای فعال اکسیژن (ROS) می باشد و در مسیر گلوتاتیون - آسکوربات برای احیای رادیکال فعال مونودهیدروآسکوربات فعالیت می کند . مطالعه ی حاضر به منظور بررسی ساختار و عملکرد آنزیم فوق، با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک طراحی شد . بدین منظور توالی های مرتبط از بانک اطلاعاتی جمع آوری شده و با توالی ژن مذکور همردیف شدند . درخت فیلوژنتیک با کمک توالی های همردیف ترسیم و بسیاری از مشخصات این آنزیم از جمله توالی آمینواسیدی، موقعیت پروتئین در سلول ، نواحی موتیف ، درصد بازهای موجود در توالی نوکلئوتیدی، ساختار ثانویه و ساختار سه بعدی آنزیم با استفاده از نرم افزارهای مختلف ، مورد بررسی قرار گرفت . ژن مذکور دارای 1436 نوکلئوتید با قابلیت کد کردن 479 آمینواسید می باشد که بیشترین شباهت را به گیاهان سورگوم ، گندم، برنج و ذرت نشان داده است . آنالیز ساختار پروتئینی، خارج سلولی بودن، درصد بیشتری از آبگریزی و نواحی موتیف pyr-redoxin و NAD-binding را اثبات می کند . همچنین بررسی ساختار ثانویه، نشان دهنده ی 78/3 درصد ساختار مارپیچ آلفا، 41/1 درصد ساختار چین خورده ی بتا و 13/6 درصد ساختار دور بتا یا دور معکوس بوده است .
کلیدواژه ها:
نویسندگان
آزاده محسنی
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
الهام سلیمانی
کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قربانعلی نعمت زاده
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
علی دهستانی کلاگر
استادیار پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان ، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :