بررسی بیوانفورماتیکی ژن MDHAR از گیاه آلوروژوس لیتولاریس

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 664

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0867

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

مونودهیدروآسکوربات ردوکتاز یکی از آنزیمهای مهم مسیر آنتیا کسیدانت برای سمیت زدایی رادیکالهای فعال اکسیژن (ROS) می باشد و در مسیر گلوتاتیون - آسکوربات برای احیای رادیکال فعال مونودهیدروآسکوربات فعالیت می کند . مطالعه ی حاضر به منظور بررسی ساختار و عملکرد آنزیم فوق، با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک طراحی شد . بدین منظور توالی های مرتبط از بانک اطلاعاتی جمع آوری شده و با توالی ژن مذکور همردیف شدند . درخت فیلوژنتیک با کمک توالی های همردیف ترسیم و بسیاری از مشخصات این آنزیم از جمله توالی آمینواسیدی، موقعیت پروتئین در سلول ، نواحی موتیف ، درصد بازهای موجود در توالی نوکلئوتیدی، ساختار ثانویه و ساختار سه بعدی آنزیم با استفاده از نرم افزارهای مختلف ، مورد بررسی قرار گرفت . ژن مذکور دارای 1436 نوکلئوتید با قابلیت کد کردن 479 آمینواسید می باشد که بیشترین شباهت را به گیاهان سورگوم ، گندم، برنج و ذرت نشان داده است . آنالیز ساختار پروتئینی، خارج سلولی بودن، درصد بیشتری از آبگریزی و نواحی موتیف pyr-redoxin و NAD-binding را اثبات می کند . همچنین بررسی ساختار ثانویه، نشان دهنده ی 78/3 درصد ساختار مارپیچ آلفا، 41/1 درصد ساختار چین خورده ی بتا و 13/6 درصد ساختار دور بتا یا دور معکوس بوده است .

نویسندگان

آزاده محسنی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

الهام سلیمانی

کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

قربانعلی نعمت زاده

استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

علی دهستانی کلاگر

استادیار پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان ، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • رضوی، خ. ملبوبی، منع. فرهی آشتیانی، ص. قناتی، ف. محسن ...
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • A.H.C. Huang, R.N. Trelease, T.S. Moore, 1983.Plant Peroxisomes, Aca-demic Press, ...
  • B. Halliwell, J.M.C. Gutteridge, 1989.Free Radicals in Biology and Medi-cine, ...
  • C.H. Foyer, G. Noctor, 2000Oxygen processing in photosynthesis: regu-lation and ...
  • J .G. Sc and alio s, 1997 Mole cu lar ...
  • K. Asada, 1996, Radical production and scavenging in chloroplasts, in: ...
  • Kangasjarvi, S., Lepisto, A., Hannikainen, K., Pippo, M., Luomala, E., ...
  • Miller, G., Suzuki, N., Ciftci-Yilmaz, S., and R., Mittler. 2009. ...
  • نمایش کامل مراجع