آنالیز بیوانفورماتیکی توالی پروتئینی Hsp 90 در بین گونه های مختلف راسته Saccharomycetales بر اساس داده کاوی

مخمرهای راسته Saccharomycetales توانایی تحمل شرایط نامساعد گرمایی و تولید پروتئین شوک حرارتی را دارند .در این برریس توالیاسید آمینه مربوط به پروتئینهای شوک حرارتی (Hsp90) گونه هایی از این راسته از بانک زن استخراج و توسط نرم افزار MEG5 مقایسه شدند . نتایج آنالیز با روش NJ، تمامی گونه ها را با تفاوت های نسبی در یک گروه قرار داد و گونه Lodderomyces elongisporus به عنوان برون گروه انتخاب شد. سپس توالیهای پروتئین همردیف و مورد آنالیز دومین قرار گرفتند که بر اساس نتایج همه توالیها دارای دومین های HATPase ( Histidine kinase-like ATPases و( HSP(Multi domin بودند ، همچنین بر اساس همردیفی اسید آمینه مشخص گردید که در داخل هر کلاد حداقل مقدار اختلاف در اسید آمینه وجود دارد که صحت دندورگرام حاصل را نشان می دهد ، توالی پروتئین Hsp90 از گونه Saccharomyces cerevisiae توسط نرم افزار CLCbio آنالیز گردید ، این پروتئین دارای وزن ملکولی 88/92 کیلودالتون و نقطه ایزوالکتریک 5/05 بود و بر اساس نمودار هیدروفوبیستی بیشترین میزان هیدروفویی در فاصله آمینواسید 100 تا 110 واقع شده است ، می توان بیان داشت که د رقسمت بیرونی پروتئین قرار داردند .

کلیدواژه ها:

Saccharomycetales ، تنوع میان گونه ای ، پروتئین 90Hsp