بررسی ترجیح کدونی ژن های رمز کننده پروتئین DI در چهار علف هرز

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کردونی ژن های رمز کننده پروتئین (Qβ) D1 در علف های هرز به عنوان یکی از مهمترین عوامل کاهنده عمکرد گیاهان زراعی ، توالی 80 آیزوفرم از چهار علف هرز مختلف از پایگاه اطلاعات NCBI جمع آوری شد و با استفاده از نرم افزار gene infinity ترجیح کدون های مختلف اسید آمینه ها و کدون های پایان تجزیه و تحلیل شد . نتایج نشان داد که علف هرز بروموس برای اسید آمینه ایی که دارای دو کدون بودند ، اسید آمینه سیستئین ، فنیل آلانین و لایزین کدون ایی را ترجیح داده اند که به نوکلوتید های C و G ختم می شوند . در صورتی که آسپارتیک اسید ، گلوتامیک اسید، هیستسدین ، آسپارژین ، گلوتامین و تیروزین کدون هایی که به A , T ختم شده اند ترجیح داده شده است . برای اسید آمینه های که دارای جهار و شش کدون هستند ، کدون هایی که به A و T ختم شده اند ترجیخ داده می شود . در عفل هرز فالاریس برای اغلب اسید آمینه ها یک کدون با درصد بسیار بالا ( بین 80% تا 90% ترجیح داده شده است و در صد ناجیزی از بیان به دیگر کدون ها اختصاص یافته است و در علف های هرز تاج خروس و سلمه تره، اغلب اسید آمینه ها کدون های پایان یافته با A و T را جیحح داده اند . در ثصورتی که سیستئین ، گلایسین ، آسپارژین و تیوزین کدون هایی را ترجیح می دهند که به نوکلوتید Cیا G ختم شده است . بطور کلی در اغلب موارد بین دو گیاه پهن برگ و دو گیاه باریک برای مورد مقایسه ترجیح کدونی مشابهی برای ژن های رمز کننده پروتئن D1 وجود دارد .

کلیدواژه ها:

ترجیح کدونی ، آیزوفرم ، علف هرز ، پروتئین D1 ، ژن psbA