طبقه بندی نظاممند ابزارهای مدیریت خودکار اطلاعات زیست پزشکی با رویکرد داده کاوی

مقدمه:با توجه به پیشرفت های روزافزون علوم زیست پزشکی و فناوری های بیوانفورماتیک پزشکی، در سالهای اخیر اطلاعات زیست پزشکی در قالب متن با حجمی کلان مواجه شده است. افزون بر مقالات که حاوی دستاوردهای بیوانفورماتیک پزشکی هستند؛ یافته های پروژه های زیست پزشکی و پرونده ها و مدارک پزشکی بیماران نیز در قالب متن موجودند. مدیریت اطلاعات به منظور دستیابی به اطلاعات نهان متون بیساختار و نگهداری و سازماندهی اطلاعات موجود، در حوزه بیوانفورماتیک پزشکی هزینه های زیادی دربردارد. با توجه به حجم کلان اطلاعات و مقرون به صرفه نبودن استفاده از فرد متخصص، نیازمند خودکارسازی روند حصول، سازماندهی، استفاده، ثبت و نگهداری اطلاعات زیست پزشکی هستیم. در سوی دیگر به روز بودن اطلاعات در حوزه های مرتبط با سلامت و بیوانفورماتیک پزشکی، برای پرهیز از انجام تحقیقات موازی در سراسر جهان بسیار ضروری است. به منظور کاهش هزینه ها و جلوگیری از اتلاف زمان و منابع، میتوان با استفاده از داده کاوی، اطلاعات موجود در قالب متون را مدیریت و سازماندهی کرد. چنین نگرشی اطلاعات در سطح کلان را به اطلاعات طبقه بندی شده و ساخت یافته، با حجم بسیار پایینی تبدیل می کند. این مقاله سعی دارد مدیریت خودکار اطلاعات زیست پزشکی را با استفاده از متن کاوی بررسی نماید.همچنین این مقاله چند معیار ارزیابی جهت دسته بندی ابزارهای استخراج و مدیریت خودکار اطلاعات حوزه زیست پزشکی، پیشنهاد می دهد. در این مقاله سعی شده تا با جمع آوری اطلاعات مفصلی درباره ویژگی های ابزارها، زمینه مناسبی برای انتخاب ابزار مناسب جهت مدیریت و استفاده از اطلاعات متنی برای خوانندگان فراهم آورد.روش بررسی: به منظور انجام یک تحقیق مروری، جهت طبقه بندی ابزارهای استخراج خودکار اطلاعات، بیش از 40 مطالعه مرور شد. در طی انجام این بررسی، مخزن دادگان bioinformatics stav مورد جست وجو قرار گرفت. همچنین جدیدترین ابزارها به صورت دقیق بررسی، و براساس معیارهای کیفی پیشنهادی شامل: وظیفه، نوع اطلاعات، نوع کاربرد، بصری سازی، نوع دسترسی و نوع داده ورودی و خروجی دسته بندی شد. یافته ها: دسته بندی ارایه شده در این مقاله نشان داد؛ انتخاب ابزار و روش در مدیریت و استخراج اطلاعات زیست پزشکی بسیار وابسته به معیارهای پیشنهادی هستند. همچنین مشخص شد، معیارهای پیشنهادی کیفی با استفاده از نمایان کردن نقاط ضعف و قوت ابزارها و روشها میتوانند کمک بزرگی مقایسه کیفی آنها باشند. به علاوه در طی بررسی ها، تمامی منابع و ابزار موجود جهت استخراج و مدیریت اطلاعات زیست پزشکی با رویکرد متن کاوی، از جمله: نوع اطلاعات موجود در متون، دادگان، پایگاه- داده ها، ابزار و روش ها شناسایی و به صورت نظام مند دسته بندی شدند.نتیجه گیری: این مقاله برای مدیریت اطلاعات کلان زیست پزشکی در قالب متون، از روش های متن کاوی بهره می برد. پیش فرض های حل مساله مدیریت اطلاعات زیست پزشکی را به صورت نظام مند و با نگرشی سودمند ارایه می کند. این مقاله عوامل تاثیرگذار بر روند استخراج و مدیریت اطلاعات زیستپزشکی را بررسی و با استفاده از معیارهای پیشنهادی دسته بندی می نماید؛ از این رو پیشنهاد میشود پیش از انتخاب روش و ابزار برای حل مساله استخراج و مدیریت اطلاعات زیست پزشکی مورد توجه قرارگیرد.

کلیدواژه ها:

مدیریت اطلاعات زیست پزشکی ، استخراج خودکار اطلاعات ، متن کاوی ، دسته بندی منابع و ابزار