بررسی نیروهای غیرپیوندی بین نانو عملگر زیستی پریفولدین و نانو محموله ی پپتیدی

استفاده از نانوماشین ها در آینده، انقلابی را در پزشکی باعث خواهد گردید. استفاده از ادوات نانو در پزشکی، منجر به تشخیص سریع بیماری در مراحل آغازین آن شده و درمان بیماری با دارورسانی هوشمند یا جراحی هایی در سطح سلول خواهد شد.در این راستا، کشف هر نوع نانو ماشینی که می تواند جهت دارو رسانی موثر در مقیاس نانو به کارگرفته شود می تواند بسیار جالب توجه باشد. در پژوهش های گذشته نشان داده شده است که پروتئین پریفولدین یک نانو عملگر است و می تواند با تغییرات شرایط محیطی یک نانو محموله ی جهش یافته یدارویی را گرفته یا آنرا رها نماید. اما در مورد جزئیات نیروهای بین نانو محموله و نانو عملگر بحثی نشده است. در این پژوهش با استفاده از نرم افزاهای Ligplot ،Gromacs و Matlab به ارایه ی انواع تعاملات فیزیکی بین نانو عملگر پریفولدینی و یک نانو محموله،در دو وضعیت متفاوت اسیدی و خنثی پرداخته شده است. به صورت ویژه، تعداد نیروهای غیرپیوندی هیدروژنی، تعداد تعاملات هیدروفوبیکی و مقدار سایر نیروهای غیرپیوندی بین مولکولی در دو حالت pH اسیدی و خنثی ارایه شده است. نتایج به دست آمده به خوبی نشان می ده د ک ه نیروهای جاذب ه د ر شرایط محیطی خنثی،به مراتب بزرگتر از نیروهای بین نانو عملگر و محموله در محیط اسیدی است.