تعیین جایگاه فیلوژنی ویروس موزائیک ایرانی قیاق در استان گلستان بر اساس ژن پروتئین پوششی

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 322

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NCOCA04_041

تاریخ نمایه سازی: 2 مهر 1398

چکیده مقاله:

یکی از مهمترین پوتی ویروس های غلات ویروس موزائیک ایرانی قیاق (Iranian Johnson grass mosaic virus, IJMV) می باشد. به منظور تعیین توالی و جایگاه فیلوژنی و نیز مقایسه IJMV جدایه استان گلستان با سایر جدایه های آن در ایران و نیز سایر پوتی ویروس های غلات در دنیا، از ذرت، سورگوم و قیاق نمونه بردای صورت گرفت. پس از آزمو الایزا، با استفاده از آزمون مولکولی RT-PCR و جفت آغازگرهای عمومی پوتی ویروس ها، Oligo1n و Oligo2n، بخشی از پروتئین پوششی ویروس به اندازه 327 جفت باز تکثیر گردید. پس از تعیین توالی، همردیف سازی چندگانه ترادف حاصل از IJMV و سایر جدایه های آن در ایران و نیز سایر پوتی ویروس های غلات در دنیا، با استفاده از نرم افزار Clustal X صورت گرفت. سپس درخت فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار MEGA5 به روش Maximum parsimony بدست آمد. طبق نتایج حاصل از آنالیز فیلوژنتیکی و نیز بررسی درصد شباهت جدایه های مختلف، پوتی ویروس های غلات در 6 گروه متمایز قرار گرفتند. جدایه استان گلستان با شباهت بیش از 90 درصد در کنار جدایه های شیراز در یک گروه و نیز در کنار ویروس موزائیک زآ (با 87 درصد تشابه) ولی در زیرگروهی جداگانه قرار گرفت. این جدایه کمترین میزان تشابه را با MDMV جدایه گرگان نشان داد.

کلیدواژه ها:

ویروس موزائیک ایرانی قیاق ، جایگاه فیلوژنی ، RT-PCR

نویسندگان

الهام محمودی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، دانشگاه تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

سعید نصراله نژاد

دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

فروزه سادات مصطفوی نیشابوری

دانشجوی دکترا بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی زابل