بررسی بیوانفورماتیکی پروموتر ژن ERG3 موثر در پاسخ به تنش ها در برنج و ذرت

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 771

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NCPAS01_052

تاریخ نمایه سازی: 27 فروردین 1393

چکیده مقاله:

یکی از رو شهای مهم مقابله با انواع تن شها استفاده از ژ نهای مقاومت است. بیان ژن ها ناشی از عناصر تنظیمی موجود در پروموتر آ نهاست، بنابراین شناسایی پروموتر با عناصر القاءپذیر و پاسخ دهنده در برابر عوامل تنش زا یکی از راهکارهای کارآمد در تولید گیاهان تراریخت مقاوم به تنش هاست. ژنERG3 یکی از ژ نهای موثر در پاسخ به تن شهای زیستی و غیرزیستی است که در برنج و ذرت شناخته شده است. بدین منظور با استفاده از بانک های اطلاعاتیNCBI وPhytozome به ترتیب توالی CDS و2000 جفت باز بالادست ژنERG3 در برنج و ذرت به عنوان پروموتر انتخاب گردید و با نر مافزارهایPLACE و PlantCARE مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که پروموتر ژن مذکور در هر دو گیاه شامل عناصر پاسخ به نور، خشکی، تنش گرمایی، جاسمونیک اسید، آبسیزیک اسید، جیبرلیک اسید، شرایط بی هوازی، سالسیلیک اسید و سایر عناصر دفاعی بودند. حضور این عناصر دخیل در تنش های غیرزیستی تأییدی بر نقش ژنERG3 درپاسخ به این گونه تنش ها است

کلیدواژه ها:

بررسی پروموتر ، ERG3 /تنش های زیستی و غیرزیستی ، بیوانفورماتیک

نویسندگان

زهرا پورخورشید

بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.

سیدمحسن سهرابی

پژوهشکده زیس تفناوری، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.

علی دادخدایی

بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.

علی نیازی

پژوهشکده زیس تفناوری، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • دانشگاه اصفهان 10 و 1 آبان ماه 1391 ...
  • دانشگاه اصفهان 10 و 1 آبان ماه 1391 ...
  • Ahn, S., Anderson J, A., Sorrells, M.E and S, Tanksley. ...
  • Dagostino, D., Aversano, M., Chiusano, L. (2005) A pipeline for ...
  • Dixon, R. A. and Lamb, C. J. (1990) Molecular communication ...
  • Kim, C. Y., Lee, S., Park, H. C., Bae, C. ...
  • Nurnberger, T., Nennstiel, D., Hahlbrock, K. and Scheel, D. (1995) ...
  • Seki, M., Umezawa, T., Urano, K and Shinozaki, K. (2007) ...
  • Shinozaki, K and Yamagachi - Shinozaki, K. (2007) Gene networks ...
  • Sreenivasulu, N., Sopory, S.K and P.B, Kavikishor. (2007) Deciphering the ...
  • Departnent of Plant Production _ Plant Breeding, College of Agriculture, ...
  • Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran. ...
  • نمایش کامل مراجع