شناسایی مولکولی و بررسی پراکنش ویروس زردی غربی چغندرقند در مزارع چغندرقند خراسان رضوی

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 685

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NCPDA01_2202

تاریخ نمایه سازی: 12 دی 1393

چکیده مقاله:

ویروس زردی غربی چغندرقند (Beet western yellows virus-BWYV) عضو تیپ جنس Polerovirus از خانواده Luteoviridae می باشد که به عنوان یکی از مهم ترین ویروس های آلوده کننده چغندرقند شناخته شده است. به منظور بررسی و تعیین پراکنش ویروس زردی غربی چغندرقند (BWYV) طی تابستان و پاییز 1390-1389 تعداد 1145 نمونه از مزارع چغندرقند استان خراسان رضوی جمع آوری شد. نمونه برداری به دو صورت جمع آوری گیاهان دارای علائم زردی، ضخیم و شکننده شدن برگ ها، کوتولگی برگ ها و سیاه شدن برگ ها، چروکیدگی و لکه های نکروتیک برگ ها و همچنین به روش تصادفی جهت تعیین پراکنش انجام شد. برای شناسایی اولیه و تعیین پراکنش از روش های سرولوژیک TAS-ELISA و DAS-ELISA استفاده شد که تعداد 200 نمونه آلوده تشخیص داده شد. بطور کلی متوسط میزان پراکنش این ویروس در استان خراسان رضوی برابر 17/56% بود. بیشترین درصد آلودگی در شهرستان چناران با 23/335 و کمترین میزان در شهرستان قوچان با 10/9% مشاهده شد. جهت شناسایی نهایی در جدایه های ایرانی شناسایی شده در این تحقیق، ژن سوم با اندازه ی تقریبی 609 جفت باز در آزمون RT-PCR تکثیر و از میان نمونه های آلوده هفت جدایه جهت تعیین توالی نوکلئوتیدی انتخاب شدند. ترادف های توالی یابی شده در پایگاه اطلاعاتی NCBI ثبت شده، با سایر ترادف های جهانی مقایسه شدند. نتایج همولوژی با استفاده از نرم افزار Dnaman version 7 مورد بررسی قرار گرفت که نتایج حاصله نشاندهنده بیشترین شباهت آنها با ایزوله ها ی چینی و آمریکایی بود. این شباهت در سطح نوکلئوتیدی 99/5% و در سطح آمینو اسیدی 99/3% بود. همچنین نتایج به دست آمده از آنالیز فیلوژنتیکی ژن ORFIII با استفاده از نرم افزار MEGA5/5/2 بکارگیری روش Neighbor Joining بیشترین درصد تشابه را با استرین های چینی تأیید نمود. همچنین توالی یابی این ژن استراتژی بیان ژن readthrough را ثابت کرد. هم ردیف سازی توالی آمینواسیدی ORFIV جدایه های ایرانی با سایر جدایه های موجود در بانک ژن، قابلیت انتقال تمامی جدایه های ایرانی را توسط شته ناقل تأیید کرد.

کلیدواژه ها:

ویروس زردی غربی چغندرقند (BWYV) ، چغندرقند ، آر ان ای ، دی ان ای ، الیزا

نویسندگان

قاسم ترابی

دانشجوی کارشناسی ارشد، استادیار، استاد و استادیار گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

محسن مهرور

دانشجوی کارشناسی ارشد، استادیار، استاد و استادیار گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

بهروز جعفرپور

دانشجوی کارشناسی ارشد، استادیار، استاد و استادیار گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

محمد زکی عقل

دانشجوی کارشناسی ارشد، استادیار، استاد و استادیار گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • اسکندری ف، آل آقا ن..، حجارود ق. و همتی ک. ...
  • یزدپناه ک، 1361، لیست مشروح بیماری های ویروسی و شبه ...
  • بیات ح. 137. شناسایی و تعیین پراکنش ویروس زردی چغندرقند ...
  • شوشتری س.، عفرپور ب. و فلاحتی رستگار م. 1389. بررسی ...
  • Beuve, M., Stevens M., Liu H.-Y.. Wintermantel W.M., Hauser S., ...
  • Clark M.F., and Adams A.N. 1977. Charact erization of the ...
  • Duffus, J. E. and Russell G 1975. Serological relationship between ...
  • Duffus, J. E. 1981. Beet western yellows virus-A major component ...
  • Fortass, M. Van der Wilk F.. Heuvel J.F.J.M., and Goldbach ...
  • Guilley, H., Richards K., and Jonard G 1995. Nucleotide sequence ...
  • Hewings, A. D. and D'Arcy C. J. 1986. Comparative charact ...
  • Hill, S., Lane A.. and Hardwick, N.V. 1991. The incidence ...
  • Tamaki, G. and L. Fox 1982. Weed species hosting viruliferous ...
  • Tian, T., Medina _ Mayhew D.E., Maeda S., and Falk ...
  • Veidt, I, Lot H., Leiser M., Scheidecker D., Guilley H., ...
  • Watts, L. 1975. The response of various breeding lines of ...
  • Xiang, H.-Y., Dong S.-W., Zhang H.Z., Wang W.L, Li M.Q., ...
  • Zink, F. and J. Duffius 1972. Association of beet western ...
  • Zhou, C.-J.. Xiang H.-Y., Zhuo T., Li D.W., Yu J.L, ...
  • نمایش کامل مراجع