CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)
عنوان
مقاله

APPLICATION OF NEXT-GENERATION SEQUENCING TECHNOLOGIES IN PLANT GENETICS

اعتبار موردنیاز: ۰ | تعداد صفحات: ۱ | تعداد نمایش خلاصه: ۳۹۱ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۲
کد COI مقاله: NIAC01_022
زبان مقاله: انگلیسی
حجم فایل: ۱۴.۵۹ کلیوبایت
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

اصل مقاله فوق در بانک مقالات سیویلیکا موجود نیست. مقالات کنفرانس‌های کشور توسط دبیرخانه‌های مربوط منتشر می‌شوند و در صورتی که اصل مقاله توسط دبیرخانه منتشر نشده باشد، امکان ارائه آن توسط سیویلیکا وجود ندارد. در صورتی که نویسنده این مقاله هستید، می‌توایند اصل مقاله را جهت درج در بانک مقالات به سیویلیکا ارسال نمایید.

خرید و دانلود PDF مقاله

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

مشخصات نویسندگان مقاله APPLICATION OF NEXT-GENERATION SEQUENCING TECHNOLOGIES IN PLANT GENETICS

Rahim Ahmadvand - Seed and Plant Improvement Research Institute, Mahdasht Ave. 3185, Karaj, Iran

چکیده مقاله:

The advent of remarkable technology, next-generation sequencing (NGS) has opened a new horizon in molecular biology. This technology is considered as the second revolution after the introduction of PCR machine. NGS technologies allow direct and cost-effective sequencing of multiple DNA fragments in parallel to produce millions of short sequence reads in an impressive speed and cost-effective manner compared with Sanger sequencing. The result of these studies provides the knowledge for basic research. Additionally, these data could be applied to improve crop yield. At present, different platforms are available in the market including SOLiD/Ion Torrent PGM from Life Sciences, Genome Analyzer/HiSeq 2000/MiSeq from Illumina, and GS FLX Titanium/GS Junior from Roche Company. These technologies are routinely being applied in a variety of aspects, including de novo sequencing, mate-pair, whole-genome sequencing, targeted resequencing, transcriptome profiling and epigenetic. To date, the NGS platforms have been used to sequence the genome of cucumber, coca, apple, barely, banana and tomato in combination with Sanger sequencing. Also, wild strawberry, muskmelon, watermelon, chickpea and orange genomes were sequenced using next generation sequencing platforms alone. Whole-genome sequencing provides a reference genome for crop research studies. Resequencing of multiple cultivars and land races has become affordable by NGS and the resulted data could be used for phylogeny studies, single nucleotide polymorphism (SNP) discovery and the study of functional genes. In addition, the NGS technologies have enabled researchers to sequence mRNA (RNA-seq), rRNA, tRNA, and other non-coding RNA from plants in different conditions including biotic and abiotic stresses and developmental stages. The generated data set can be applied for gene discovery, gene functional studies and molecular marker development. RNA-Seq has been used as a powerful and cost-efficient tool for advanced research in many areas. Compared with microarray, RNA-Seq is more efficient in gene expression profiling; because it avoids many limitations of microarray such as, the dependence on prior knowledge of the organism, cross-hybridization and dye based issues. This technology has been used in transcriptome profiling studies for various plants, including maize, rice, soybean and potato. The generated data set provide a baseline for future experiments and create a sequence resource. In epigenetic, large scale chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay and DNA methylation analysis are other important applications of next generation sequencing technologies. In spite of the remarkable progress in sequencing technologies, highly repetitive and also heterozygous or polyploid genomes in plants still remain an issue. Although NGS makes genome sequences available, the data analysis and biological explanations are the limitations of this technology.

کلیدواژه‌ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
http://www.civilica.com/Paper-NIAC01-NIAC01_022.html
کد COI مقاله: NIAC01_022

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Ahmadvand, Rahim, ۱۳۹۲, APPLICATION OF NEXT-GENERATION SEQUENCING TECHNOLOGIES IN PLANT GENETICS, اولین کنفرانس بین المللی ایده های نو در کشاورزی, اصفهان, دانشگاه آزاد اسلامی واحد خوراسگان, http://www.civilica.com/Paper-NIAC01-NIAC01_022.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (Ahmadvand, Rahim, ۱۳۹۲)
برای بار دوم به بعد: (Ahmadvand, ۱۳۹۲)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات پیشنهادی مرتبط

مقالات مرتبط جدید

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.