بررسی فیلوژنتیکی ژن کاتالاز سنتاز در چند گونه گیاهی بر اساس توالی های کدکننده با استفاده از تکنیک in silico AFLP

آنزیم کاتالاز نقش مهمی را در جلوگیری از آسیب‌های ناشی از تنشهای محیطی مانند خشکی و شوری دارد.این آنزیم از طریق تجزیه رادیکال‌های اکسیژن آزاد به آب واکسیژن باعث کاهش صدمات ناشی از تنشهای محیطی میشود. به منظور بررسی روابط فیلوژنتیکی این ژن در 9 گونه گیاهی، آنالیز in silico AFLP بر روی توالی های کدکننده (cDNA) آن انجام شد. پس از هضم توالی های cDNA با استفاده از دو آنزیم PSTI وCVIAII پروفیل قطعات آنها رسم شد. پروفیل قطعات تولید شده نشان داد که 14 باند مشترک در بین این گونه ها وجود دارد. کوچکترین قطعه حاصل شده مربوط به Zea mays, Bracypodium distachyon, Triticum aestivum و Oryza sativa بوده که اندازه آن 6 جفت باز بوده است که هر چهارتای این گونه ها عضو خانواده گرامینه ها میباشند همچنین بزرگترین قطعه ای که تولید شده مربوط به گونه Triticum aestivum با طول 605 جفت باز میباشد. درخت فیلوژنی حاصل از این آنالیز با استفاده از روش حداکثر درست نمایی و الگوریتم Neighbor joining برای این نه گونه رسم شد وآنها را در پنج کلاستر قرار داد.

کلیدواژه ها:

کاتالاز ، آنالیز فیلوژنتیکی ، in silico AFLP