CIVILICA We Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

Dimension reduction in the computational model of the CaMKII phosphorylation process

اعتبار موردنیاز : ۰ | تعداد صفحات: ۲ | تعداد نمایش خلاصه: ۶۷ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۸
کد COI مقاله: NSCMED08_552
زبان مقاله: انگلیسی
نسخه کامل مقاله در کنفرانس ارائه نشده است و در دسترس نیست.

مشخصات نویسندگان مقاله Dimension reduction in the computational model of the CaMKII phosphorylation process

  zeinab Tajik Mansoury - Motor Control and Computational Neuroscience Laboratory, School of ECE, College of Engineering, University of Tehran, Tehran, Iran
  Fariba Bahrami - Motor Control and Computational Neuroscience Laboratory, School of ECE, College of Engineering, University of Tehran, Tehran, Iran
  Mahyar Janahmadi - Neuroscience Research Center and Department of Physiology, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran
  Mehdi Borjkhani - Electrical Engineering Department, Urmia University of Technology,West Azerbaijan,Iran

چکیده مقاله:

Background and Aim : CaMKII (Calcium calmodulin-dependent protein kinase II) is one of the important protein kinases in the hippocampus. Phosphorylation of CaMKII is due to the Ca2+ (calcium II ion) concentration increasing for short term in the postsynaptic neuron. The phosphorylation of CaMKII can lead to LTP (Long Term Potentiation) induction in the synapses. The significance of the CamKII phosphorylation process has motivated some researchers to develop computational models of this process. However, these models are very detailed and complicated and also can not be used for dynamical analysis purposes. So, in this paper, we present our simplified model of CaMKII phosphorylation process. The model does not have unnecessary complexities and can easily be used for dynamical analysis purposes.Methods : Here a Hodgkin-Huxley type approximation method is used to model the CamKII phosphorylation process. We considered the twelve_dimentional nonlinear model of the CamKII phosphorylation (Borjkhani et al.,2018)as a black box, which its input and output are Ca2+ and phosphorylated CamKII, respectively. We inserted different step inputs into the validated model. The outputs were the step responses of a first-order system. Therefore, we recorded steady-state and time constant of response for each concentration of Ca2+. Then we identified nonlinear relation of Ca2+ with the time constant and the nonlinear relation of Ca2+ with steady-state of CaMKII phosphorylation by choosing high adjusted R square models.Results : We calculated the output signal of phosphorylated CaMKII of our first-order model and the twelve_dimentional model for 19 times. We used the hypothesis test with student s t distribution, one of the statistical inference methods(Lyman Ott et al.,1977), to compare our model and the twelve_dimentional model results. We set the equality of mean of the sampling distribution of two models for each time sample as the null hypothesis(H0) and inequality of mean of the sampling distribution of two models for each time sample as the alternative hypothesis(HA). Then we used student s t distribution to find the probability of observation assuming that the H0 is true. So, we calculated the p_value for each time sample. The results show that for 99 percent of time samples, the H0 was not rejected. Therefore, we can confidently state that means of these two model sampling distributions are equal by the significance level of 0.01. Then, our proposed model is validated to be used for the purposes mentioned. Conclusion : The presented simplified model can be used for different purposes, such as modeling of LTP and memory formation for neurodegenerative diseases like drug addiction.

کلیدواژه‌ها:

Dimension Reduction; CaMKII phosphorylation;nonlinear dynamic model;computational model

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-NSCMED08-NSCMED08_552.html
کد COI مقاله: NSCMED08_552

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Tajik Mansoury, zeinab; Fariba Bahrami; Mahyar Janahmadi & Mehdi Borjkhani, ۱۳۹۸, Dimension reduction in the computational model of the CaMKII phosphorylation process, هشتمین کنگره علوم اعصاب و پایه و بالینی, تهران, دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی ایران, https://www.civilica.com/Paper-NSCMED08-NSCMED08_552.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (Tajik Mansoury, zeinab; Fariba Bahrami; Mahyar Janahmadi & Mehdi Borjkhani, ۱۳۹۸)
برای بار دوم به بعد: (Tajik Mansoury; Bahrami; Janahmadi & Borjkhani, ۱۳۹۸)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: ۵۵۴۰۳
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.