نرم افزار رایانه ای تحت وب تشخیص گونه های قارچی (FUNGID)، مطالعه موردی: جنس Phaeoacremonium

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 360

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

PPC01_118

تاریخ نمایه سازی: 23 مهر 1398

چکیده مقاله:

به منظور تسهیل در شناسایی گونه های قارچها یک نرم افزار بر پایه وب طراحی گردید. بخش اول این برنامه برای تشخیص گونه های جنس Pythium طراحی گردیده بود و اکنون بخش دوم آن برای تعدادی از گونه های جنس Phaeoacremonium آماده شده است. این برنامه به راحتی در رایانه های شخصی با حداقل امکانات سخت افزاری و نرم افزاری قابل راه اندازی است. این برنامه میتواند توسط کاربر ویرایش گردد و با وارد ساختن صفات ریخت شناختی و داده های ریخت سنجی گونه ناشناخته در بخش جستجو (search)، تعدادی از گونه های ثبت شده در پایگاه داده به عنوان گونه های احتمالی به کاربر پیشنهاد و وی بر اساس توصیف گونه های پیشنهادی و سایر اطلاعات ضمیمه به انتخاب یکی از گونه ها راهنمایی میشود. این برنامه در زبان برنامه نویسی تحت وب ASP.NET توسعه یافته است. پایگاه داده باSQL.SERVER پشتیبانی میشود و به راحتی و به صورت رایگان در دسترس است. در این نرم افزار برای هریک از گونه های جنسPhaeoacremonium صفات ریخت شناسی و داده های ریخت سنجی شامل رنگ کلنی در محیط MEA، ساختار کنیدیوفور، حداقل و حداکثر طول کنیدیوفور، نوع فیالید، توالیDNAکه قبلا در GenBank برای گونه های جنس Phaeoacremonium ثبت گردیده، مشخص شده اند. این برنامه قابل گسترش به سایر ارگانیسم ها مانند کنه ها، حشرات، نماتدهای انگل و غیر انگل گیاهی، باکتریها و سایر قارچها و شبه قارچها نیز است. به حالت آسان برای استفاده (user friendly) طراحی شده، از طریق وبگاهwww.fungid.ir قابل دستیابی بوده و اولین برنامه تحت وب تشخیص ریخت شناختی گونه های قارچی با تاکید بر گونه های جنس Phaeoacremonium است که در ایران پردازش و معرفی گردیده است.

نویسندگان

محدثه فرشباف بدر

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان

سمانه نوریان بارانلو

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان

علیرضا علیزاده

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان

علی چناری بوکت

بخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان شرقی، سازمان تحقیقات،آموزش و ترویج کشاورزی، تبریز، ایران