مقایسه دو روش استخراج DNA از رسوبات جنگل های حرا به منظور انگشتنگاری جامعه باکتریایی

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 870

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

PWAE01_131

تاریخ نمایه سازی: 25 مرداد 1392

چکیده مقاله:

امروزه روشهای گوناگونی برای استخراج DNA از رسوبات دریایی موجود است اما به دلیل شرایط خاص اکوسیستم جنگلهای حرا باید روشی موثر مورد استفاده قرار گیرد. دو روش عمده که برای استخراج DNA از رسوبات و خاک استفاده میشود بر پایهاستفاده از دو آنزیم لیزوزیم و پروتئیناز K میباشد. هدف از پژوهش حاضر مقایسه دو روش فوق میباشد. نتایج نشان داد با وجود با استفاده از روش اول محصول بیشتری به دست میآید اما DNA به دست آمده قابلیت انجام PCR را ندارد که میتوان دلیل آن را در وجود ناخالصیهایی همچون هومیک اسید دانست. به هرحال به دست آوردن محصول DNA با کیفیت میتواند گام مهمی در مراحل بعدی بررسی جوامع میکروبی در رسوبات باشد

نویسندگان

مصطفی عموپوربهنمیری

فارغ التحصیل کارشناسی ارشد میکروبیولوژی از دانشگاه شهید چمران اهواز

حسین معتمدی

استادیاردانشگاه شهیدچمران اهواز

ابوالقاسم هدایت خواه

فارغ التحصیل کارشناسی ارشد میکروبیولوژی از دانشگاه شهید چمران اهواز

شهریار عصفوری

استادیار، دانشگاه خلیج فارس بوشهر، دانشکده مهندسی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Acha, Darfo, et al. 2005 _ Sulfate -Reducing Bacteria in ...
  • Craig, Jeffrey W., et al. 20 10.Expanding Small -Molecule Functional ...
  • Delmont, Tom O., et al. 201 1.Accessing the Soil Metagenome ...
  • Dias, A. C.. et al. 2010.The bacterial diversity in _ ...
  • Fisher, MM, and EW Triplett 1 999 .Automated approach for ...
  • Hall, Justine R., et al. 2008 .Molecular Charac terization of ...
  • He, Y., et al. _ .Evaluation of extraction and purification ...
  • Liang, Yuting, et al. 20 12.Microbial Functional Gene Diversity with ...
  • Liu, Xueduan, et al. 2003 .Molecular Diversity of S ulfate ...
  • Luna, G. M.. A. Dell'Anno, and R. Danovaro 2006.DNA extraction ...
  • Miller, D. N., et al. 1 999.Evaluation and optimization of ...
  • Nemergut, D. R.. A. P. Martin, and S. K. Schmidt ...
  • Tsai, YL., and BH. Olson 1991.Rapid method for direct extraction ...
  • Zhou, J., M. A. Bruns, and J. M. Tiedje 1996.DNA ...
  • Zhou, Jizhong, et al. 2002.Spatial and Resource Factors Influencing High ...
  • نمایش کامل مراجع