الگوریتم جدید برای تشخیص آنتی بادی های موثر بر آنتی ژنHIV براساس ماشین بردار پشتیبان

ایدز یا سندرم نقص ایمنی اکتسابی نوعی بیماری دستگاه ایمنی است که توسط ویروس نقص ایمنی (HIV) ایجاد می شود. این آنتی ژن دارای دو نوع HIV-1 و HIV-2 با ساختار ژنی/آنتی ژنی متفاوت می باشد. دفاع اختصاصی سیستم ایمنی در مقابله با آنتی ژن ها تولید آنتی بادی های اختصاصی است. آنتی بادی ها از نظر توالی اسیدآمینه ای (ساختار اول) با یکدیگر متفاوتند که این اختلاف ساختار باعث تفاوت در عملکرد و قدرت خنثی کنندگی آنها می شود. یکی از دلایل ضعف سیستم ایمنی در برابر آنتی ژن HIV، تاخیر آن در تولید آنتی بادی موثر و قابلیت جهش سریع ویروس می باشد. تزریق آنتی بادی های موثر بر HIV، در همان ساعات اولیه آلودگی، می تواند نقش بسزایی در کنترل و حذف عفونت داشته باشد. از این دیدگاه، تعیین ساختار آنتی بادی های موثر بر HIV نیازی ضروری است. در این مقاله، روشی جدید برای ارزیابی و تعیین آنتی بادی های موثر بر HIV با استفاده از ماشین بردار پشتیبان ارائه شده است. همچنین، ما با معرفی دو ویژگی جدید احتمال وقوع اسید آمینه در هم ترازی و همسایگی اسید آمینه ها در توالی، توانسته ایم عملکرد روش پیشنهادی را بهبود بخشیم. نتایج تجربی بیانگر عملکرد بسیار مناسب روش پیشنهادی (با حساسیت 81/80 %، ویژگی 99/66% ، ارزش پیش بینی مثبت 98/29 % و دقت 96/20 %) در مقایسه با دیگر الگوریتم های رقیب می باشد.

کلیدواژه ها:

آنتی بادی ، HIV ، ماشین بردار پشتیبان ، ساختار اول آنتی بادی