آنالیز فیلوژنی پروتئین VP2 ویروسهای بیماری بورس عفونی طیور جدا شده از فارمهای ایران

بیماری بورس عفونی ( گامبورو ) یکی از شایعترین بیماریهای ویروسی طیور است که خسارات فراوانی بر جای می گذارد . متداول ترین راه پیشگیری از این بیماری استفاده از واکسن های زنده intermediate می باشد . ژنوم ویروس عامل،RNAدو رشته ای که پنج پروتئین را کد می کند . از بین این پروتئینها، VP 2دارای مکانهای آنتی ژنی مهم است و بیشترین تغییرات آنتی ژنی در ویروسهای گامبورو به علت تغییر در الگوی اسیدهای آمینه منطقه بشدت متغیر hyper variableپروتئین VP 2 ویروس است . برای بررسی میزان تغییر در آنتی ژنیسیته و بیماری زایی ویروس گامبورو، سی و نه توالی VP 2 جدایه های ایران ویازده ویروس واکسن از داده پایگاه GenBank اخذ شد . آنالیز فیلوژنی این جدایه ها نشان میدهد که تمامی جدایه های ایران در یک کلاستر و متفاوت از کلاسترهای ویروسهای واکسن قرار می گیرند، اما قرابت آنتی ژنیک بیشتری با ویروسهای واکسن که بطور متداول مصرف می شوند دارند . جایگزینی اسید های آمینه در جدایه های ایران بررس ی شد و بیشترین جایگزینی ( شش مورد ) در جدایه اخیر ایران دیده می شود . مهمترین آنها جهش آدنین به گلوتامیک اسید در ناحیه اپی توپ پیوسته پروتئین VP 2 است که نقش مؤثری در شناسایی توسط آنتی بادی ها دارد. اثر این جهش روی پایداری مولکول VP 2 با محاسبه میزان تغییر ان رژی ) -)GΔ بررسی شد . پایداری مولکول در اثر این جهش افزایش یافته است .