جلال غلام نژاد
فروغ سنجریان
ابراهیم محمدی گل تپه
ناصر صفایی

در این مطالعه، 10438 EST که در پایگاه NCBI در رابطه با تعامل گندم و بیمارگر  Mycosphaerella graminicola  (فرم غیرجنسی Zymoseptoria tritici)  ثبت شده بودند، استخراج شدند. پروتئین­های غیر تکراری و مرتبط با EST­ ها در بانک اطلاعاتی  NCBI  توسط نرم افزار SEQtoolsبه دست آمدند. این پروتئین ها بر اساس نوع، طبقه بندی شده و در 279 گروه قرار گرفتند. سپس در سایتKEGG ، مسیر 112 عدد از این پروتئین­ها تجزیه و تحلیل و 55 مسیر شناسایی و ارتباط بین این مسیرها و پاسخ­های دفاعی گندم مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه این مسیرها بر اساس عملکرد گروه­بندی شده و در هشت گروه عملکردی (شامل پروتئین­های دفاعی، پروتئین­های درگیر در فرایند انرژی سلولی، پروتئین­های درگیر در فرایند متابولیسم سلولی، پروتئین­های درگیر در فرایند پردازش پروتئین­ها، پروتئین­های درگیر در فرایند پردازش RNA، پروتئین­های درگیر در چرخه­های سلولی، پروتئین­های درگیر در تخریب پروتئین­ها و پروتئین­های درگیر در فرایند سیگنال­دهی سلولی) قرار گرفتند. مسیرهای متابولیکی تثبیت کربن در فرایند فتوسنتز و پروتئین­های درگیر در فرایند دفاعی به ترتیب  با دارا بودن 745 و 251 EST، در مرتبه اول و دوم قرار داشتند.. سپس نقش ESTها مخصوصا آن­هایی که در مسیرهای دفاعی گیاهی درگیر بودند به صورت موردی مطالعه شدند و عملکرد آن­ها در مسیر دفاع گیاه گندم مشخص شد. با استفاده از اطلاعاتی که این بررسی در اختیار قرار می دهد می­توان ژن­های دیگری که به طور مستقیم و همچنین غیر مستقیم در فعالیت­های دفاعی گیاهی شرکت می­­کنند، مورد بررسی قرار داد.

گندم, KEGG, NCBI, SEQtools, EST, Mycosphaerella graminicola