بررسی الگوی عدم تعادل لینکاژی و مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی جهت شناسایی مناطق ژنومی موثر بر دو قلوزایی در گوسفندان نژاد بلوچی
عنوان مقاله: بررسی الگوی عدم تعادل لینکاژی و مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی جهت شناسایی مناطق ژنومی موثر بر دو قلوزایی در گوسفندان نژاد بلوچی
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-5-10_014
منتشر شده در در سال 1393
شناسه ملی مقاله: JR_RAP-5-10_014
منتشر شده در در سال 1393
مشخصات نویسندگان مقاله:
محسن قلی زاده - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
قدرت رحیمی میانجی - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
اردشیر نجاتی جوارمی - University of Tehran
خلاصه مقاله:
محسن قلی زاده - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
قدرت رحیمی میانجی - Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
اردشیر نجاتی جوارمی - University of Tehran
دوقلوزایی از صفات مهم اقتصادی در پرورش گوسفند میباشند. صفات تولیدمثلی نه تنها در بین نژادهای مختلف گوسفند بلکه در بین گوسفندان یک نژاد نیز دارای تفاوتهای عمده میباشند. در این تحقیق مطالعه الگوی عدمتعادل لینکاژی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی با استفاده از ۴۲۴۱۶ نشانگر تکنوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی موثر بر نرخ دوقلوزایی در گوسفند بلوچی انجام شد. نمونههای خون از ۹۶ راس گوسفند بلوچی همراه با دادههای فنوتیپی مرتبط به صفات زایش و رشد متعلق به دو گله از ایستگاه تحقیقاتی عباسآباد تهیه شد. نمونهها با استفاده از ریزآرایههای نانویی گوسفندی ( ۵۰K ) تعیین ژنوتیپ شدند. با استفاده از نرمافزار PLINK ماتریس خویشاوندی IBS و هاپلوتیپها برای افراد محاسبه و مطالعه ارتباط هاپلوتیپها برای نرخ دوقلوزایی برای ۴ شکم زایش با در نظر گرفتن بعد اول آزمون MDS و اثر گله بهعنوان متغیر کمکی انجام شد. برای کنترل نرخ اشتباه در سطح خانواده، از تصحیح بنفرونی استفاده شد. ارتباط معنیدار پیشنهادی برای هاپلوتیپها روی کروموزومهای ۱، ۱۰ و ۱۵ شناسایی شد. مقدار عدم تعادل لینکاژی با استفاده از آماره r۲ بین تمام جفت لوکوس ها محاسبه شد.. در فاصله کمتر از ۱۰ Kb میانگین r۲ برابر ۳۳/۰ بوده و برای نشانگرهای با فاصله ۲۰۰ تا ۵۰۰ کیلو باز میانگین r۲ ۰۸۶/۰ بود. مقدار عدم نعادل لینکاژی در گوسفند بلوچی نسبت به آنچه در گاو شیری گزارش شده کمتر بوده و مشابه دیگر جمعیتهای کوسفند می باشد. مطالعه بیشتر این نواحی در شناسایی ژنهای کاندید دوقلوزایی در گوسفند کمک شایانی خواهد نمود.
کلمات کلیدی: Twining, Sheep, LD, Haplotype, Genomic wide association, دو قلوزایی, گوسفند, LD, هایپلوتیپ, پویش ژنومی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1285313/