بررسی بیوانفورماتیک اختصاصیت miR-۲۲۲-۳p در اتصال به ژن های درگیر در لوسمی لنفوبلاستیک حاد در کودکان
عنوان مقاله: بررسی بیوانفورماتیک اختصاصیت miR-۲۲۲-۳p در اتصال به ژن های درگیر در لوسمی لنفوبلاستیک حاد در کودکان
شناسه ملی مقاله: JR_PSJ-20-3_008
منتشر شده در در سال 1401
شناسه ملی مقاله: JR_PSJ-20-3_008
منتشر شده در در سال 1401
مشخصات نویسندگان مقاله:
محمد طاهری - Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
فاطمه خاوری - Student Research Committee, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
پژمان مولائی - Student Research Committee, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
پریسا حبیبی - Neurophysiology Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
فاطمه نوری - Department of Pharmaceutical Biotechnology, School of Pharmacy, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
خلاصه مقاله:
محمد طاهری - Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
فاطمه خاوری - Student Research Committee, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
پژمان مولائی - Student Research Committee, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
پریسا حبیبی - Neurophysiology Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
فاطمه نوری - Department of Pharmaceutical Biotechnology, School of Pharmacy, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
سابقه و هدف: لوسمی لنفوسیتی حاد (Acute lymphocytic leukemia) ALL، نوعی سرطان است که بر روی سلول های سفید خون تاثیر می گذارد. این بیماری به سرعت پیشرفت می کند و نیاز به درمان فوری دارد. لوسمی لنفوبلاستیک حاد، شایع ترین نوع لوسمی است که کودکان را تحت تاثیر قرار می دهد. در خلال این بیماری افزایش مولکول miR-۲۲۲-۳p مشاهده شده است. از روش ریزآرایه می توان برای بررسی اتصالات این miRNA و ژن های هدف استفاده کرد، که این مورد با محدودیت هایی روبه رو است. بر همین اساس، در این مطالعه، از روش های کامپیوتری و بیوانفورماتیکی توسط نرم افزارهای مختلف و اختصاصی استفاده شد.
مواد و روش ها: ژن های هدف با استفاده از الگوریتم های مختلف موجود در پایگاه های Mirbase، TargetScan، NCBI و RNAhybrid مشخص شدند و بر اساس امتیازات به دست آمده، اهداف دارای بالاترین تمایل شناسایی شدند.
یافته ها: یافته های این مطالعه نشان داد که ژن های CDH۴، AJAP۱، HNRNPA۰، UBN۱ و ZNF۶۱۸ به عنوان اهداف بالقوه با اختصاصیت بالاتری برای miR-۲۲۲-۳p می باشند.
نتیجه گیری: دو عامل میزان انرژی آزاد منفی و تعداد جفت بازهای تشکیل شده بین miRNA و UTR-۳’ ژن های مختلف در انتخاب اهداف با اختصاصیت و تمایل بالاتر نقش دارند.
کلمات کلیدی: miRNA, Acute lymphocytic leukemia, Bioinformatics, miR-۲۲۲-۳p, miRNA؛ لوسمی لنفوبلاستیک حاد؛ بیوانفورماتیک؛ miR-۲۲۲-۳p
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1521146/