طراحی نرم افزار پیش بینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی
عنوان مقاله: طراحی نرم افزار پیش بینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-1-1_004
منتشر شده در در سال 1391
شناسه ملی مقاله: JR_ARGU-1-1_004
منتشر شده در در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:
ثریا رفیعی - دانش آموخته کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان
مرادپاشا اسکندری نسب - دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان
داریوش سلیمی - پژوهشکده فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان
طاهر هرکی نژاد - پژوهشکده فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان
روناک خرمتایی - پژوهشکده فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان
خلاصه مقاله:
ثریا رفیعی - دانش آموخته کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان
مرادپاشا اسکندری نسب - دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان
داریوش سلیمی - پژوهشکده فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان
طاهر هرکی نژاد - پژوهشکده فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان
روناک خرمتایی - پژوهشکده فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان
در تحقیق حاضر اقدام به تولید نرمافزار MAS شد. این نرمافزار برای پیشبینی ارزش ارثی از تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی استفاده مینماید. بعضی از ژنهایی که یک صفت را کنترل میکنند، میتوانند نسبت به بقیه دارای اثرات بزرگی باشند. این قبیل ژنها، ژنهای با اثر بزرگ نامیده میشوند که در QTL هامکانیابی میشوند. دنبال کردن الگوی توارث این قبیل QTLها میتواند برای کمک به انتخاب مورد استفاده قرار بگیرد. این موضوع مجالی برای افزایش برنامههای پیشرفت ژنتیکی حیوانات اهلی به وسیله انتخاب به کمک نشانگرها (MAS) را فراهم میسازد. کارایی انتخاب به کمک نشانگرها بر شاخصی متشکل از اطلاعات فنوتیپی و مولکولی پایه گذاری شده است. نرم افزار MAS براساس روشهای مدل مختلط (MMM) با زبان برنامهنویسی C# تهیه شد. در این نرم افزار از مدل دام برای پیشبینی ارزش ارثی به فرم ماتریسی استفاده شد. با تعیین پلی مورفیسم ناحیه پروموتور ژن DGAT۱، پس از استخراج DNA از نمونههای خون، مراحل PCR روی نمونه های DNAانجام گرفت. فراوانیهای آللی و ژنوتیپی حیوانات مشخص شد. از نرم افزار MAS برای پیش بینی ارزش ارثی تعداد ۸۰ راس از برههای نر گله اصلاح نژادی طرح ملی اصلاح نژاد گوسفند افشاری مزرعه آموزشی دانشگاه زنجان استفاده شد. جهت مقایسه نتایج پیش بینی ارزش ارثی با روش مذکور، از نرم افزار SAS استفاده شد. مقایسه نتایج پیشبینی ارزش ارثی با نرمافزار MAS و SAS، نشاندهنده اثر ورود نشانگرهای مولکولی در انتخاب براساس تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی است.
کلمات کلیدی: ارزش ارثی, جایگاه صفت کمی, گوسفند افشاری, نشانگر مولکولی
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1609945/