میلاد قاسمزاده - دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
عبدالرضا سوادی - استادیار دانشگاه فردوسی - مشهد
محمدزکی خاوری - دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
امیررضا تقدیسی - دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد

در این مقاله سعی داریم, تا با استفاده از یک الگوریتم موازی به نام کامبت که زاتا یک الگوریتم سریال است را به نحوه که در ادامه به شرح آن می پردازیم، قسمتی های از الگوریتم را به صورت موازی با رابط موازی سازیOpenMP پیاده سازی کنیم, تا با استفاده از آن در سطح DNA پروتئین برای مطابقت رشته DNA در ناحیه کد , دو زبان برنامه نویسی FORTRAN و C را با رابط موازی سازی OpenMP مورد مقایسه قرار دهیم. اما هدف از ارائه این مقاله این است, که کدام یک زمان کمتری را برای مطابقت دو رشتهDNA ناحیه کد در سطح پروتئین ارائه می دهد.در حالی زمان اجرای برنامه در هر دو زبان با تعداد پردازنده ای متفاوت مورد بررسی قرار میگردند، تا در پایان این مقاله به هدف اصلی مورد نظرمان که، از کدام یک از این دو زبان در آزمایشات آینده برای مطابقت دو رشته DNA استفاده نماییم.

زبان برنامه نویسیC / OpenMP , FORTRAN/مطابقت رشته DNA